Basic Information

Symbol
hsa_PAN3_0003800
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0029835 hsa_circPAN3_010 hsa-PAN3_0093
Host gene
PAN3
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
13:28748409-28830676 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
13:28174272-28256539 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-214.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -229.80 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 129.99
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(((((..(.((.((((((((((......((...(((((.....((((((......(((....))).....)))))).(((((...((((((((.((((((((...((((..((((.(((......((((((.(((((((((((.((((.((..((.....))..))(((((((((((((.((((.....(((((((.((((.(((((..(.((((((.....((.((((((...............)))))).)).....)))))).)....))..))))))).)))))))..))))......((((((.((....((((....(((((.(...((....))...).))))).....)))).......))...)))))))))))))))))))(((...(((....(((((((......((((((.........((((...(((.(((.((((.....(((((.....))))).....))))))).)))..))))......))))))...........)))))))))).....))).)))).)))..)))))))).))).)))))).)))).)))).))).))))).))).)))))....)))))((((((((.(....(((.......((.((((...((((((((.(.(((((((..........((((.((.....(((((......))))).....)).))))........)))......)))).).)))))))).)))).)).......)))...).)))).)))).)))))...)).....)).)))..)))))...))..)..)))))...
Thermodynamic Ensemble Prediction
.(((((..{.((.((((((((((.,....((...(((((.....((((((......(((....)))..,..)))))).{((((...((((((((.(({{,.||,..,,{{,.{{{{,{(({{,.{{((((,,.(((((((((((.((((.,,..((.....))..},(((((((((((((.((((.....(((((((.((((.(({((..(.((((((,{,..{{.((((((,,.......,.....,))))).)}.,}}.)))))).)....))..))})))).)))))))..))))......((((((.((....((((....(((((.{...((....)).,.).))))).....)))).......))...)))))))))))))))))))(((...({(,...(((((((......((((((.........((((...(((.({({((((.....(((((.....))))).,...))))))).)))..))))......))))))...........)))))))}}},,...))).)))).)))..)))))))){|||.}},,,,})))}.,,)),))).))))).))).)))))....})))}{(((((((.{....(((.......((.((((...((((((((.{.((((..,..........((({.{,.....(((((......)))))......,,)))}........|}}......)))).}.)))))))).)))).)).......)))...}.)))).)))).)))))...)).....)).)))..)))))...))..}..)))))...
Forensic Context

No forensic context available.