Basic Information

Symbol
hsa_PAN3_0015200
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0100179 hsa_circPAN3_031 hsa-PAN3_0029
Host gene
PAN3
Type of circRNA
Intron-Exon-Intron
Location (GRCh37)
13:28813716-28855516 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
13:28239579-28281379 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-403.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -432.89 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 421.49
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((..........))((((((((((((.((((.(((.((.......)).)))))))))...))))))...........((((((((((((((((..(((........)))....((((((((.(.(.(........).).))))))))).....((((((((.(....(((.......((.((((...((((((((.(.(((((((..........((((.((.....(((((......))))).....)).))))........)))......)))).).)))))))).)))).)).......)))...).)))).))))................((((((...(((((((....)).)))))...)))))))))))))))).....))))))......((..((((.(((((......))))).....((....))..(((((((.((((((((((((.(.((((....)))).).)))....................(((((...(((((((.(((....)))..(((((......(((((......((((...))))......)))))......)))))....(((.....))).........((((....))))........(((((.(((.((...((((....)))).(((((((...(((((.(..(((....)))..).)))))..)))))))...........))))).))))))))))))...((((.(((...((((............((((....))))))))...))).))))...(((....))))))))(((((..((((((((.(((.((((((........))))).....).))).))))))))........((((..(((((((.((((((((.......).))))))))))))))..))))....((((....))))...((((((((.((((((((....((((.(((((((.....))))))).)))).(((((.(((((((((((...(((.((((.((((...((((.(((((((((((.......)))))..))))))))))...)))).))))..)))....))).(((.(((.((((((((......((((((....)))))).............)))))))).))))))))))..))))))))).(((((...)))))....((((((...(((....))).)))))).)))))))).)))))))))))))...........)))))))))..((((....))))...((((.((......)).))))...((((((((((((((..........)))).))))))))))....(((((((((((((((....))).))...........((((.((((.......)))).))))..)))))))))).)))))))...((((..(((((.((..((((((....)))))))).))))).)))).((((....))))...))))..))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((,.........}}({(((((((({{,,,((.(((.((.......)).)))}))}.}...}))})),},,,......{((((((((((((((({.(((....,,..}}|,,..((((((((,{,{.,......,.|||.,})))))))..,..((((((((.{....(((.......((.((((...((((((((.{.((((.............((({.{{.....(((((......)))))......,,))},........||}....,,)))).,.)))))))).)))).)).......)))...}.)))).)))).|,.......,.....{(((((...(((((((....)).)))))...)))))))))))))))).....)})))|,,....((..(((,.(((((......))))).....((....))..(((((((,(((((((({{{{,|.((((....)))).|{|||{,.,{.{{{{.......,}}|,||,...|||}}}}.(((....|}},.(((((......(((((......((((...))))......)))))......)))))....,,{,....}||,,{,,,.,,{,,{,,.,,}}||.....,,,(({((({{{,,...|,|}},...})),||||||{...||||{.|..{{{,,,,|||,.,,|||||,,||}}}}|||,.,,,|,,.|{||,{{({{{{{{|||,..,(({({{{{,,.((({{(((.......{{{{{{{{|||.||{,,...,}},}}}}...,{{...,||||||||.,{,,..((((((((.(((.((((((......,.)))),....,).))).))))))))..,{(((.((((..(((((((.((((((((.......),})))))))))))))..))))..)))||,{{,,}|,....|||||,,,..((((((({...((((.(((((((.....))))))).))))}|||||,,((((((,......|||.||||}||||}},((((.(((((((((((.......)))))..))))))))))...))))}))))}},,.....)))}|||},||}||{((({,,,,,,,|{{({{....)))))}.......,|||||{||,,,,,}))})}}))))},})|||||||,(((({,,.||}}},...{||{|||},||{.,,.)))}))}},|{|||,||,|.,,,}),)),))))}.......},})))))))},..((((....,,},,}}}|||}||}},...}},)},,.,,((((((((((((((,.........})))}}}))))))))....(((((((((((((((....))).)).,,,,,.....{{{|,||||...,..,})}}.))))..)))))))))).)))))))...((((..(((((.({..((((((....))))))}).))))).)))).{(((,...,,,),,,))))..)),)))
Forensic Context

No forensic context available.