Basic Information

Symbol
hsa_PAN3_0016300
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0100180 hsa_circPAN3_033 hsa-PAN3_0041
Host gene
PAN3
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
13:28830429-28841013 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
13:28256292-28266876 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-127.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -140.11 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 113.11
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(...((((((...(((((((....)).............(((((((((((.......(((((.(((....))).)))))..............................(((((......)))))........(((((.(((..(((((..((((.(((((((....((..(((((.(((....)))....(((((.((((.((.............((((((...(((((((....)).)))))...))))))..............)).)))))))))(((...((..(((((......))))).))..)))....))))).))...(((((.....)))))....))).))))))))..)))))....))).))))).((((.....(((......)))....))))(((((......(((((......((((...))))......)))))......)))))....(((.....)))...........))))))))))).....(((((.(((......))).))))).)))))..))))))...)(((.(..(((....)))..).)))
Thermodynamic Ensemble Prediction
({,.((,(({{{,,{..(((....})),.......,(((((((.{....(((.......((.((((...((((((((.{.((((..,..........((({.{,.....(((((......)))))......,,)))}........|}}....,.)))).}.)))))))).)))).)).......)))...}.)))).)))),}}}....,}},,,..|||{{{...(((((((....}).))))).,,)))}},...........,...((((((((....(({......(((((......))))).||,.((....)).....,.....,,(({{{.{||,,.((((....)))).(((((((.,(.((((.......)))).,)....))))))).(((,,,.}}}..(((((......(((((......((((...))))......))))).,....)))))....,{(.....))}..,.....,,.,|,..,})))}........((((((((((({....))),...))))}}))))))).))}}}..}))....)))))))).)))
Forensic Context

No forensic context available.