Basic Information

Symbol
hsa_PAN3_0016400
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0029850 hsa_circPAN3_034 hsa-PAN3_0220
Host gene
PAN3
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
13:28830429-28841348 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
13:28256292-28267211 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-155.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -169.50 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 115.81
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((((((........(((....))).........(((((((.(....(((.......((.((((...((((((((.(.(((((((..........((((.((.....(((((......))))).....)).))))........)))......)))).).)))))))).)))).)).......)))...).)))).))))))))...((((((((..(((.((((.(((((((.((((..(((((......)))))....(((((...((((((((....(((......(((((......))))).....((....)).............(((((.(((...((((....)))).(((((((.((.((((.......)))).))....))))))).(((....)))..(((((......(((((......((((...))))......)))))......)))))....(((.....))).........((((....)))).........((((((((((((....)))....))).))))))))).)))))..)))....)))))))).)))))................)))))))).))).)))))))....))))))))...))))(...((((......(((((((((.(((..........))))))))...))))))))...)
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((((({........(((....})),.......,(((((((.{....(((.......((.((((...((((((((.{.((((..,..........((({.{,.....(((((......)))))......,,)))}........|}}......)))).}.)))))))).)))).)).......)))...}.)))).))))))))...((((((((..(((.((((.(((((({,((((..(((((......)))))....{{{{(...((((((((....(({......(((((......))))).|{,.((....))...........,,(({{{.{|{,,.((((....)))).(((((((.,(.((((.......)))).})....))))))).(((,,,.}}}..(((((......(((((......((((...))))......))))).,....)))))....,{(.....))|..,.....,,.,|....})))}........((((((((((((....))),...}))}}}))))))),))}}}..)))....)))))))).)))}},..,.....}...,,.)))))))).))).)))))))....))))))))...))))(...((((......((({,{{({,{{{..,,..,,,.}}}},,|||..,}))))))...)
Forensic Context

No forensic context available.