Basic Information

Symbol
hsa_PAN3_0016500
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0100181 hsa_circPAN3_035 hsa-PAN3_0013
Host gene
PAN3
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
13:28830429-28841538 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
13:28256292-28267401 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-188.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -206.20 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 149.17
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(..((((((((((((((((....)))........((((((((.(....(((.......((.((((...((((((((.(.(((((((..........((((.((.....(((((......))))).....)).))))........)))......)))).).)))))))).)))).)).......)))...).)))).))))................((((((...(((((((....)).)))))...))))))......((((((((((.(((((((...(((......(((((......))))).....(((((((((....((........)).((((.(.((((....)))).).))))...................(((((...(((((((.(((....)))..(((((......(((((......((((...))))......)))))......)))))....(((.....))).........((((....))))........(((((.(((.((...((((....)))).(((((((...(((((.(..(((....)))..).)))))..)))))))...........))))).))))))))))))...((((.(((...((((............((((....))))))))...))).))))...(((....))))))))......)))))))))............)))))))))).))).))))))))))))))).....)))))...........).((((((((.......).)))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
.,..((((((((((((((((....})),.......((((((((.{....(((.......((.((((...((((((((.{.((((..,..........((({.{,.....(((((......)))))......,,)))}........|}}......)))).}.)))))))).)))).)).......)))...}.)))).)))).|,.............{(((((...(((((((....)).)))))...)))))}......((((((((({.(((((((...({,...,..(((((......))))).,...(((((((((.....,.,,,,{{{|,.{{|{,|.((((....)))).|{||||,.,|.{,,,.......,},|{{|{...|||||||,(((....|||..(((((......(((((......((((...))))......)))))......)))))....{{(.....))},.,.,...,,.,{,,..,}}},.....,{{{{,{{{||,...,,||||}}..,|||,{((((((...(((((.{..(((....)))..}.)))))..)))))))}},.,,.{,,,||}}|||||||||}}}},..,(({{|{|....|||..|||.|{||,,,,||.,,)))).))},},,.,},.,,}}...{((....)))|||},..,,,.)))))))))..,{{.....},))}))))))).,)).))))))))))))))).....)))))...........}.((((((((.......),}))))))
Forensic Context

No forensic context available.