Basic Information

Symbol
hsa_PAN3_0019000
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0029856 hsa_circPAN3_042 hsa-PAN3_0028
Host gene
PAN3
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
13:28834584-28846208 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
13:28260447-28272071 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-207.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -224.27 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 162.35
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((..(((((.(((((...((((((((....(((......(((((......))))).....((....)).............(((((.(((...((((....)))).(((((((.((.((((.......)))).))....))))))).(((....)))..(((((......(((((......((((...))))......)))))......)))))....(((.....))).........((((....)))).........((((((((((((....)))....))).))))))))).)))))..)))....)))))))).)))))....)).)))..)))))...((((.(((((((((..(((((...(((((...((((((((.......(((((((((((.(((..........))).........(((((((((.......((((((((.(((.((((((........))))).....).))).))))))))..(((((.((((..(((((((.((((((((.......).))))))))))))))..))))..))))).((((........)))).....(((.((((...((((.(((((((.....))))))).))))))))))).((((((.......))).))))))))))))((((.(((((((((((.......)))))..))))))))))...))))))))))).......)))))))).))))).)))))))))))((((((....))))))........((((((....)))))).)))))))...
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((.,(((((.(((((...((((((((....(({......(((((......))))).|{,.((....))...........,,(({{{.{|{,,.((((....)))).(((((((.,(.((((.......)))).})....))))))).(((,,,.}}}..(((((......(((((......((((...))))......))))).,....)))))....,{(.....))|..,.....,,.,|....})))}........((((((((((({....))),...}))}}}))))))),))}}}..)))....)))))))).)))}}....}}.}))..)))))...{{|{,||||{{|||,.||||,{((({,((({.((((((((.......(((((((((((.(((,,....,}},,,,.........{((((((((.......((((((((.(((.((((((......,.)))),....}).))).))))))))..{((((.((((..(((((((.((((((((.......),})))))))))))))..))))..))))}.((((,{,...,})))).....(({{((((...((((.(((((((.....))))))).))))))))))).((((({.......))).))))))))))))((((.(((((((((((.......)))))..))))))))))...))))))))))).......)))))))).))))),{(({..,.}}}||((((....))))},.......,|}||||,,,,}}}},)}),,))}),,.
Forensic Context

No forensic context available.