Basic Information

Symbol
hsa_PAN3_0020900
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0029862 hsa_circPAN3_050 hsa-PAN3_0064
Host gene
PAN3
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
13:28840852-28851513 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
13:28266715-28277376 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-205.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -222.22 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 213.30
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((((...(((((......((((...))))......))))).......((((((..(((.....))).........((((....))))(((((((((.((((.(((.....((((....)))).(((((((...(((((.(..(((....)))..).)))))..)))))))............(((.(((((((((.....((((.(((((...((((((((.......(((((((((((.(((..........))).........(((((((((.......((((((((.(((.((((((........))))).....).))).))))))))..(((((.((((..(((((((.((((((((.......).))))))))))))))..))))..))))).((((........)))).....(((.((((...((((.(((((((.....))))))).))))))))))).((((((.......))).))))))))))))((((.(((((((((((.......)))))..))))))))))...))))))))))).......)))))))).))))).)))).......((((((....))))))........((((((....)))))).))))))))))))))))))).)))))).)))......((((((...(((....))).))))))...))))))((((((.......))))))............)))))))(....(((((...((((.((......)).)))).))))).)
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((((...(((((..,...((((...})))......))))}.{,,..,{((,,.,{{{(.....}}|,.|,|...,,.,{{,,,,}}||..,.,{{{{({({{(({.....{{||,...}))).{{(((((...(((({.|..(({....)))..,.)))))..))))))}{{,,,,{|,,..{{{.((((((((({{|.,,{{{|{{,((({.((((((((.......(((((((((((.(((,,....,}}},,}.........{((((((((.......((((((((.(((.((((((......,.)))),....,).))).))))))))..{((((.((((..(((((((.((((((((.......),})))))))))))))..))))..))))}.((((,{,...,})))).....(({{((((...((((.(((((((.....))))))).))))))))))).((((({.......})).))))))))))))((((.(((((((((((.......)))))..))))))))))...))))))))))).......)))))))).))))}{{(({....,,,|{((((....))))),........|||||{||,.,,,))),)})})))))})}|||}}}}{||||}}.}}},},...,|||}}}}}}}|..{{||||}}||.{((({.((.|,...,}.)).))))).,,....,.,})))}.))}}))){,,..,{{{{...{{{{.{{......)}.)))}.))})),)
Forensic Context

No forensic context available.