Basic Information

Symbol
hsa_PAN3_0021600
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0100183 hsa_circPAN3_054 hsa-PAN3_0086
Host gene
PAN3
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
13:28840855-28845003 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
13:28266718-28270866 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-137.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -149.80 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 126.32
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Forensic Context

No forensic context available.