Basic Information

Symbol
hsa_chr13_0100800
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-PAN3_0154
Host gene
PAN3
Type of circRNA
Intergenic-Intergenic
Location (GRCh37)
13:28726644-28727454 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
13:28152507-28153317 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-202.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -219.12 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 169.77
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((..(((((((((((((.((((.((((((((((((.((((((((((((.(((((((.((...(((((((((((((((((((((((.(((((.((.(((((...((((........(((.((.(((((..(((((...((((........(((...(((((....))))))))))))....)))))..))))).)))))........))))....(((((..................)))))...(((((((((((...))))).....)))).)).......(((((....)))))..(((((((.((((((...))))))(((((((((((((((..(((((.((((....))))...(((((.....)).)))(((((..(((((........................))))).))))).........(((((...(((((.........)))))..)))))(((((((((((...((........))...))))))))))))))))...))))))).))).)))))............(((((........)))))....(((((((..((((..............))))....)))))))......((((.(((..........)))))))......(((((.((.((......)))).)))))...........))))))))))))..)).))))).).))))))))).))))))..)))))))...)).))))))).))).)))))))..)))))))))))))).)))).)))))))))))))..)))((.........))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((..(((((((((((((.((((.((((((((((((.{(((((((((((.(((((((.((...(((((((((((((((((((((((.(((((.{{,({(((,..{{{{........{{(.,,.(((((..(((((...((((........({{...(((((....)))))}}})))).,,.)))))..))))).}})))........,}}}....(((((..................)))))...({(((((((((...))))).....)))).}}.......{((((....)))))..{((((((.((((((...})))))(((((((((((((((..(((({.,,,,....}},,..,(((((.....)).)))|((((..(((((........................))))).))))}.........|||{{..{((,((,...,}},}))}}...}},,|(((((((((((...((........))...))))))))))))))))...))))))).))).)))))....,{,..,{((((.{.{((((.....))))}.}.))))|}.|{.,............,{{{{{,,,{..,,|||{.....(((,{(((..........)))))))...,{{({..,.}}))},.....,)))}))))}}}.........)))))))}})))..,,.))))).).))))))))).})))))..)))))))...)).))))))).)))}}))))))..,})))))))))))).)))).)))))))))))))..)))((.........))
Forensic Context

No forensic context available.