Basic Information

Symbol
hsa_PAN3_0004900
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-PAN3_0197
Host gene
PAN3
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
13:28748454-28866905 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
13:28174317-28292768 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-617.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -662.52 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 569.92
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((......(((....))).....)))))(.((((....(((.....(((....))).....)))(((((..(..(((((((((.(((((((((((.(.((((((((((.....)).)).))..(((((((.((((((..(((((((((..........((((....(((((.....((.((((((((..((....((((...)))).))..).))))))))).....))))).))))...........))))))))).......))))))((((((.(((((((((..........((.((((...((((((((((...((((....)))).....(((((..(((((((((.(.((((..(((((((.((......(((....)))........((((((((.(....(((.......((.((((...((((((((.(.(((((((..........((((.((.....(((((......))))).....)).))))........)))......)))).).)))))))).)))).)).......)))...).)))).)))).......((((((((..(((.((((.(((((((.((((..(((((......)))))....(((((...((((((((....(((......(((((......))))).....((....)).............(((((.(((...((((....)))).(((((((.((.((((.......)))).))....))))))).(((....)))..(((((......(((((......((((...))))......)))))......)))))....(((.....))).........((((....)))).........((((((((((((....)))....))).))))))))).)))))..)))....)))))))).)))))................)))))))).))).)))))))....))))))))....((((((((.......(((((((((((.(((..........))).........(((((((((.......((((((((.(((.((((((........))))).....).))).))))))))..(((((.((((..(((((((.((((((((.......).))))))))))))))..))))..))))).((((........)))).....(((.((((...((((.(((((((.....))))))).))))))))))).((((((.......))).))))))))))))((((.(((((((((((.......)))))..))))))))))...))))))))))).......))))))))..((((((((((((((...)))).)))).))))))........)).)))))))..))))).))).)))))))))))..((((..((.....(((.((((((...(((....))).)))))).))).....))..)))).))))))))))..)))).))...((((.((((........))))))))(((((((...........((((((((((((((..........)))).))))))))))....(((((((((((((((....))).))...........((((.((((.......)))).))))..))))))))))..(((....)))(((..(((((.((..((((((....)))))))).))))).)))....(((((.(..((..(((((........)))))))..).)))))...))))))))))))).))))))))).........(((((((((((.(((((((((..(((((((((((...((((.....))))(((((....))))).........(((((....))))).......((((....)))).........((((((((....((((((((((((((....((((((((..(((((((((((....(((((((((((((((...))))))))........))))).))....))))).))))))....((((.....))))...........((((..(........)..))))......))))))))....))))))).))))))).......((((.....))))..((((.((((((....))))))..))))))))))))...))))))))))).)))))).)))..)).))))...))))).)))))))....)))).)))))))).))))..))...))))))).)..)))))....))))..)
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((......(((....)))..,..)))))(.((((....(({....,(((....})).....}}}(((((..(..(((((((((.(((((((((((({,,,,,{{{{({.....||,||{||,.(((((((.((((({..{(((((({{.....,,,,,(((({.,,(((((.....((.(((((((...(,..,.((((...)))).},..).))))))))).....))))).))},....,,,,...||||}}|||,,.....}}}})}{(((((.(((((((((..........((,((((.,,((((((((((.,.((({....}))).....(((((..(((((((((.(.((((..(((((((.(((((((((((....})),.......((((((((.{....(((.......((.((((...((((((((.{.((((..,..........((({.{,.....(((((......)))))......,,)))}........|}}....,.)))).}.)))))))).)))).)).......)))...}.)))).)))).|,......,,.....,(((((.,.(((((((....|).)))))...))))))......{(((((({{{.(((((((...((,......(((((......))))).|,..(((((((({..........,{{{{,.,{|{,|.((((....)))).{({||{{.,{.{{{{.......}}}|,||{...}}}}}}}.(((..,.|||..(((((......(((((......((((...))))......)))))......)))))....,{(.....))},.,.,...,,.,{,...}}}}}.....,,,(({({({{|,,...|,})),...|||,{{(((({...(((({.,..(({....)))..).)))))..)))))))}},.,,.||||}|}}||}||)}}}))),...}||||||},...{||,|||{.,,,,..||||,|||||}.|||,,,..,,,.,,}}...{{{...,)))|||||......})))))))).,{{,,...,|,}},))))))).,}}.)))))))))))))))}..,{{((.((((..(((((((.((((((((.......),})))))))))))))..))))..))}||,...,|||...,}}|(((({{{((,{((((...((((.(((((((.....))))))).)))))))))),,((((((.......))).)))),||||||.(((({(((,,((((..{{.((((((((((((({(((.(({{.......)))).)))......)))))))))))))).||.}}}}..}}))))})...))))))..,}}}))))).,))))))..))))}.))).)))))))))))..((((,.,,,}},}|{{.((((((,..(((....))),)))))).|||.||.,},..}},),)))))))}}}..)))).))},.((((.((((,.......))))))))(((((((..,.,......((((((((((((((..........))))}})))))))))....(((((((((((((((....))).)).,,,,,.....{{{|,||||......,}))}.))))..)))))))))).,{((....))}|((..(((((.({..((((((....))))))}).))))).))}....(((((.{..{{..(((((........)))))}}..).))))).,,))))))))))))).))))))))},.,,,},..|||||||||||,((((({{{{..{{|||||{{{|,,,||||,,...}}}){{{((,,..}})))......{{{(({((....||}||,.....}||{|,..,)})),,.......((((((((,{{,((((((((((((((.,{.((((((((..((((({(((((....(((((((((((((({...})))))))........))))).))....))))).}))))).,,,((((,....}}},..,,,,...,{({{{..,.......,)..)))),,,}.,)))))))).}}.))))))).)))))))........,||}},..,,,...{{{(.{(((((....)))))}..)))),)))))))...))))))))))).|})}}},,}}.,)).))},..,))))).))))))),.,,}))).)))))))).))))..))...))))))).)..)))))....))))..)
Forensic Context

No forensic context available.