Basic Information

Symbol
hsa_PAN3_0007600
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-PAN3_0135
Host gene
PAN3
Type of circRNA
Intron-Intron
Location (GRCh37)
13:28762095-28763311 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
13:28187958-28189174 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-280.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -307.21 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 306.41
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(.((((......(((....)))..)))))((.((((.(((..(((((.....((((...............)))).....)))))...)))........(((((......((((((.......(.(((((.......))))).).))))))....)))))......(((((..(((((((.......(((...((((((((((((((......((((..(((((..((((...((....))...))))..))))))))).........(((((......))))).(((((((((.....(((((((.((..((.((((((((((((........)))))))).......(((((.(((((....(((.........))).)))))))))).((((.((((((((...))))))))))))((((((....))))))...((((((((.....((......)).....))))))))........................)))))).)).))).))))((((((((....))))))))((((((((..((...(((((.......(((((((((((((((((((....)))))....))))))).((((...))))))))))).((((....))))...................(((...((..((((....(((..((((((.((......)).))))))..)))..))))..))....)))..((((((((((((.............)))))))))))))))))...))..))))))))....(((((((.......)))))))(((.((((((....)))))).).))..))))).)))).....)))))))).)))))))))........))))))).)))))(((..((((((..((((((....((.((((........................)))).))...)))))).))))))..)))..((((((.(.......(((((.((((((((((.((((((.((((((((.......)))))))).))))))....((((.((...)).)))).....((((((......(((((....)))))......))).)))))))))))))...........(((((((....))))))))))))......).)))))).(((((....((((.....((...))....)))).....))))).))))..))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((,.,....,,||}}.(((((((((({..(((((((((...{{{(({{{{.,....,}}},,.,,,,,.{{{{{{{.......)}}})}}.,,{{(,.,,(,,......}}}.,,,..,...}))}|,.........,((((((.(((((((((((((((...(((......)))...))).,,......,,.||..((({(((({,{,..(((({,.{((((((((((....,....{{{...,))},})))))))))}}.......,,{{,,.....))))}|,.{(((.......||||{((.((..((.((((((((((((........)))))))).,,,,.,(((,,.,||||,|,,|,|,,.......,},.,},,,}}}},.,{{{.((((((({...}))))))),}},((((((....)))))).,.((((((((..,..((......)).,,..)))))))).................,,}},..))))||,}}.}}},}}}|({{{{{||,,..)))))))))))).,.)))))))),,,.))))))))))..,}}.)))))){((((....)))))...)))))))))((((...)))).(((((((.........)))))))......................,,,,,,..,.(((((((((((..(((.,,.((((((((...))))))))..,{((({...})))|((((,..(((((((.,..((((((((((((((..((((......)))).))))))),{{{,((((({...,,,})}))))}....((((((....)))))){{{{{{{..{.{.(({((((((((.,{(,,(((......))),}}.)))},......|}})))|}|.|.||}}}))).||},},,,||||,.....}}}}............)))))))..,.)))))))...))))})))..)))))))))))}.....(((((.{(((((((((.((((((.((((((((.......)))))))).))))))....{(((.{,...}}.)))}....,((((({......,,(({,...,))))......}}}.)}})))))))))),,,,.,,....(((((((....))))))))))))..,,,,)))).)))).))).,|||.{{{{{{...{|,({{,....,,|||,.,),,}))))}}..})
Forensic Context

No forensic context available.