Basic Information

Symbol
hsa_PAN3_0018200
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-PAN3_0151
Host gene
PAN3
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
13:28830584-28866648 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
13:28256447-28292511 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-410.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -439.93 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 354.79
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..(((((((.((((((((((((((((...(((....(((((.((((.((.............((((((...(((((((....)).)))))...))))))..............)).)))))))))(((...((..(((((......))))).))..)))...((((((..(((((((((..((((((((((((....)))).(((((((.((.((((.......)))).))....)))))))((((((((((((((((((......(((((......((((...))))......)))))......)))))....(((.....)))...................))).))))))......)))).....((((....))))((((((((((((((((.(..(((....)))..).)))))...(((.((((((((((..........))))))).))).)))....(((((.((((((((.......(((((((((((.(((..........))).........(((((((((.......((((((((.(((.((((((........))))).....).))).))))))))..(((((.((((..(((((((.((((((((.......).))))))))))))))..))))..))))).((((........)))).....(((.((((...((((.(((((((.....))))))).))))))))))).((((((.......))).))))))))))))((((.(((((((((((.......)))))..))))))))))...))))))))))).......)))))))).)))))((.(((((((((...((((((.(((...........((((((....)))))).(((((.(((((((((...((((((...))))))....))).))))))...((((((.....(((((.((.........)).))))).........)))))).((((.((((........))))))))(((((((...........((((((((((((((..........)))).))))))))))....(((((((((((((((....))).))...........((((.((((.......)))).))))..))))))))))..(((....)))(((..(((((.((..((((((....)))))))).))))).)))....(((((.(..((..(((((........)))))))..).)))))...))))))).))))).))).))))))))))))))))).....))))))))))))))))))))))).))))).))))))))).))))))(((....))).........(((((....))))).......((((....)))).........))))))...))))))))).)).((((.((((.((((....))))))))))))...(((((((((((((((...))))))))........))))).)).....
Thermodynamic Ensemble Prediction
.,(((((({{((((((((((,{((({...(||....(((((.((((.{{.............{(((((...(((((((....}).)))))...))))))..............}}.)))}))))){((...{{..(((((......))))).}}..)}}...((((((..(((((((((..((((((({((((....)))).(((((((.,(.((((.......)))).,)....))))))),(((,,,.||},.(((((......(((((......((((...))))......))))).,....)))))....{{(.....))}.........,..{,,.,,,}}}.,..,,,.|||||||||.....{{{{....}))){((((((((({,{{,,...,,.{{{{|,||{{|.||||{({{({{{,.(({{({{({|.,||{.{{|{|||||||,.,,|||||||{(({,((((((((.......(((((((((((.(((,,....,}}},,,.........(((((((((.......((((((((.(((.((((((......,.)))),....,).))).))))))))..{((((.((((..(((((((.((((((((.......),})))))))))))))..))))..))))}.((((,{,...,})))).....(({{((((...((((.(((((((.....))))))).))))))))))).((((({.......})).))))))))))))((((.(((((((((((.......)))))..))))))))))...))))))))))).......)))))))),))))}{({(({{{{|||,{{(((,,,.|||},.........{{{{{{,,..}}}))).|||||,}|||||,{{.,,{(((({.,.}}}}}}....}))}))))))|..{(((({,,,{.(((((.((.,,....}.)).))))).,,....,.}))))).{(({.((((......,.)))))))){((((((..,.,......((((((((((((((..........))))}})))))))))....(((((((((((((((....))).)).,,,,,.....{{{|,||||......,}))}.))))..)))))))))).,{((....))|{((..(((((.({..((((((....))))))}).))))).))}....(((((.{..((..(((((........)))))}}..).))))).},)))))))))),))})))}))))))),))))),},,..,,|))))))))))}})))))))}))).))))).))))))))),))))}|(((....))),.....{{{(({((....||}||,...,,}||{|,..,)})),,.......))))))...))))))))),),.((((.((({{((((....))))))))))))...(((((((((((((({...})))))))........))))).)).....
Forensic Context

No forensic context available.