Basic Information

Symbol
hsa_PAN3_0020100
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-PAN3_0262
Host gene
PAN3
Type of circRNA
Intron-Exon-Intron
Location (GRCh37)
13:28840337-28841538 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
13:28266200-28267401 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-184.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -205.23 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 235.90
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(((((......)))))..((((.(((((((((.(((((((((.(((...(((((((((.((..((((((....)))).))..((((((((.((((((((((.((((((.........((((.((((((((((((((...........)))))).......((((((((((((((((((((...((((...))))....))))))(((((((........(((((.((..(((((.....((((((((.((....((.((((((..((((((......))))))...)))))))).....)).))))))))..)))))..)).)))))........))))))).......(((..(((((.((.(((((((((((.......)))))..)))))).)).))))))))...(((((...))))).)))))))))))))))))))))).))))((((((.((((((.(((((..(((((....)))))..)))))...)))))).))).)))....(((((......(((((......((((...))))......)))))......)))))......))))))..))))......((((....)))).........((((((((((((....)))....))).))))))....(((((.(..(((....)))..).))))))))))).)))))))).....)).)))))))))))).)))....)))))).)))))))))...............((((.((((((((............(((((.((.......((....((((((((.(((.((((((........))))).....).))).))))))))......)).......)).))))).)))))))))))).....)))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
.(((((......)))))..((((.(((((((((.(((((((((.(((...(((((((((.((..({((((....)))).)}..((((((((.,((((((((({((({{{.{,,,,...((((.((((((((,{,{{{,,,.,,,....,,}}}}}}}}}},{(((((((((((((.{({{{.{((((.((,{((((({((({.,...((((((.......}}}}}}.....}}))).))))))))}}}}},.}}}||.,((((({.,{{{({,.....|}}}}|,{,|,,,,|,{{,||{,,,}}},.,||||,|,.||,,..}}}}}}},...,.,,,,.}},}}}}},|,|,.{((((.((.(((((((((((.......)))))..)))))).)).))))})))}},(((((...))))).)))))))))))))}}))))))).}))}{,{,{{.{{||||,|||.,.}||||}}}}})))))))).|{|{.{||||||.|||{|,}....{{|||,,.,,.|||||.,}},.((((...))))......}}}}},|{,,,|}||}..,,{{|,}},,.|||||.....,{,{{,,,.}}}||........((((((((({{{....})),...}))}}})))),...{{{{{.|,.{{{..,,)))..,,)))))}))})),)))))))).....)).)))))))))))).))}...,)))))).)))))))))..............{((((.((((((((...........,(((((.((..{{...,|....((((((((.(((.((((((......,.)))),....,).))).))))))))......,,.......)).))))).)))))))))})),}...)))).
Forensic Context

No forensic context available.