Basic Information

Symbol
hsa_PAN3_0022100
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-PAN3_0210
Host gene
PAN3
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
13:28840883-28868064 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
13:28266746-28293927 UCSC (hg38)
External Database
circbank

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-684.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -738.51 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 911.33
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(((.......))).............(((.....)))....(((((((.((..((((((.((((((((((((.(((.....((((....)))).(((((((...(((((.(..(((....)))..).)))))..)))))))(((((.(((((((..((((((..((((((........(((((.((((((((.......(((((((((((.(((..........))).........(((((((((.......((((((((.(((.((((((........))))).....).))).))))))))..(((((.((((..(((((((.((((((((.......).))))))))))))))..))))..))))).((((........)))).....(((.((((...((((.(((((((.....))))))).))))))))))).((((((.......))).))))))))))))((((.(((((((((((.......)))))..))))))))))...))))))))))).......)))))))).)))))((.(((((((((...((((((.(((...........((((((....)))))).(((((.(((((((((...((((((...))))))....))).))))))...((((((.....(((((.((.........)).))))).........)))))).((((.((((........))))))))(((((((...........((((((((((((((..........)))).))))))))))....(((((((((((((((....))).))...........((((.((((.......)))).))))..))))))))))..(((....)))(((..(((((.((..((((((....)))))))).))))).)))....(((((.(..((..(((((........)))))))..).)))))...))))))).))))).))).)))))))))))))))))((((((((.(((((.((((.((....))..)))).))))).)))))))))))))).)).))))...)))..)))).))))).))).))))).))))))))))))).......)).)))))))..((((((((((((((....((((((((..(((((((((((....(((((((((((((((...))))))))........))))).))....))))).))))))....((((.....))))...........((((..(........)..))))......))))))))....))))))).))))))).((((((((((((((......((((((((((((....)))))...(((((.(((((((......)))))))(((((((((.(((((...(((((((((((..((((((((((.(.(((.((((((((............(((((((((((((..((((....))))...(((((((.(((....(((..(((((.(((((((((((.............(((((((((.......).))))))))............))))))..)))))))))))))...))).))))))).......(((...)))(((((((.(...(.(((..((((((..........))))))..))).).).)))))))........((((((.((...(((...((((((...))))))...))).)).))))))..((((((((.(((((...(.(((((((.((.((((((.((((((((((((((..((..(((((((((((((((((((((....))))).............((((((.((((((((((.((((((..((...))..)))))).))))..(((((.......)))))..))))))...(((((((.((((((.((((...((((((...(((((..(((((((.((((((((...(((((((((.....)))................)))))))))))))).)))(((((((((..((((((.(..(((((((((((((.............)))))))).))))))))))))..)))))))))...............))))..)))))...))))))((((((...(((...)))...))))))..)))).)).)))).)))))))))))))))))))).)))))))......))..))..)))))))......)))))))..))))))))))))))).))))))))))))))))))))))))))))))))))).))).).))).....)))))))..)))....(.((((((....)))))).)..............((.((((((...(((.....(((((.....((((((.((((......))))...)))))).........)))))...))).))))))))..)))))))).....((.(((((........))))).))....((((......))))...............))))).)))))))))............))))).....))))))))))))((((((.(.((((.....)))).).)))))).................)))))))))..........
Thermodynamic Ensemble Prediction
{,,.......(({({{{{((((,.,((((({..,,||,..{{{{,{,{,{({,,,,||||,....,{{((,((({{,...,,|,||},..,}||,{{(((((...(((((.{..(((....)))..}.)))))..))))))}||{,,{{{{,(((((((((((.{{{{{.,(({{{(((((((({((({{{{{....,,,(((((((((({.((({{{{,{|||||.,...,{{,..{((((((((,,,....((((((((.(((.((((((......,.)))),....,).))).))))))))..,{(((.((((..(((((((.((((((((.......),})))))))))))))..))))..)))}|,{{{,||,...,|||||,,,..(({(((({...((((.(((((((.....))))))).))))}))))|,,((((((.......}}}.))}}}||||}},((((,(((((((((({.......)}})),.}))))))))}...))))}))))}),,.....))))))}}||||||{({{{{||,,|||},((({{{{|||,,,.......|{{{.((((,..,|{{|||{{||,}||((({((|{{,(((((,,.|||}},...|||{||}}}||,,,|,}))})),,,{{(((,((.|....,).)).)))))..,..,.,..||||{,((,,,(((({,....,.,}},||||((({{{{.,,.,..,,..((((((((((((((..........))))}})))))))))....(((((((((((((((....))).)).,,,,,.....{{{|,||||...,..,})}}.))))..)))))))))).||{{,...|||(((,,((((({((,,((,(((,,,.},}}||||{|||||.||,..,,((({{.|..|{..|{{{{,|..,{{{||||||,.{|{|}}}}..,||||}}}}.||||,}}}}}||}}}}.}))))))))}|{(((((.(((((,((({.((,,,,||,,|}}},|||}}.}})))){{{((.,..)})))......{{,(({({....}|}}}|.,,..,||{|,..,)))),,......,|||||||||||,((((((((((((((.,{.((((((((..((((({(((((....(((((((((((((({...})))))))........))))).))....))))).}))))).,,,((((,....}}},..,,,,...,{({{{..,.......,)..)))),,,}.,)))))))).}}.))))))).)))))))....,{,..{{{{{{..,{{{{((((.,(((((....)))))|,.||||,}||||||{..,,}}))))))).,|))}}..,},}}}.|}},,,,,|}||}}|||||}}||}.}))})))}})}}))|}}}}}|{{{{{,...}}}}},|(((((((.((((....}.,)),)))))))}},}}}}))))))))),.))}.,}}}}},,..,{{(((...,|||||{{,.,,.,|||,||}}||||||||,.((.(((((((....)))))))))...||||}||||}....}}})),)})),,,,}}}(((((((.{...{.(((..((((((..........))))))..))).}.}.))))))),{,,.....{{{{......})))),,.,}))))},))))))}.{{{{,(((((,.(((((,,,,|||}|,,||}}}{,({(({{{.{|,{|||{{.{((((({(((((({..,{{,{{({{{{{{{{(({{,(((((....)))))...,}||||,,..{{{{|||{{{{,,((((.(((({{..({...|}..|}}}}}.}))}..{{{{{....,,,)))))..}}}}},...,(((((({(,,,,..,|||}}|||{{||,..,||,,..,||,(((.((((((((,..{(((((.{,...{{.|{,.....,,,,....,.)))))))))))))).)))|||||||||,,|{{|||,|,.|((((((((((((.............))))))))}})))}})))})),}))))})))},................,,,}}})}}}))}}))))|||,,{,{{((({..|||,,,|||||}..}})}|}},.,||.|||}}},,,}}))}},))},.,,})}),....|||||,,,,.}))))},..,,.,))))))),,)))}}}}}))})|||,.|||}||||||||.{{,......||||||||,,}}.,,|||||||,,(,,(((({{.,,}},,||..{((((((....}}}}}},|........,,,...{|,|{||||,..{{{.....(((((.....((((((.((((......))))...)))))).........)))))..,|||,}}}}}}||,...{((((((((((,,..,.,,......}))))))))))).,,})))...}})}.)))))),}}}..,,||||}|}}}}}}))),,,.....,,,,.}}),,))}},..,,,,,......((((((.(.((((.....)))).).))))))},}}}}}},.,}...,....}))))}},},},,}}}
Forensic Context

No forensic context available.