Basic Information

Symbol
hsa_PAN3_0022800
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-PAN3_0226
Host gene
PAN3
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
13:28841232-28866905 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
13:28267095-28292768 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-372.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -398.70 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 366.34
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((.((((((...(((((((..........)))))))..)))((((.(((((...((((((((.......(((((((((((.(((..........))).........(((((((((.......((((((((.(((.((((((........))))).....).))).))))))))..(((((.((((..(((((((.((((((((.......).))))))))))))))..))))..))))).((((........)))).....(((.((((...((((.(((((((.....))))))).))))))))))).((((((.......))).))))))))))))((((.(((((((((((.......)))))..))))))))))...))))))))))).......)))))))).))))).)))).....(((..((((((((((..........((((.((((.....(((.......)))(((((((((.(((((((.(((......))).))))))).))).))))))...(((((.((.........)).)))))..........((((((((..(((((((.............((((((((...........((((((((((((((..........)))).))))))))))....(((((((((((((((....))).))...........((((.((((.......)))).))))..))))))))))..(((....)))(((..(((((.((..((((((....)))))))).))))).)))....(((((.(..((..(((((........)))))))..).)))))...)))))))).(((((((..(((.((....))))))))))))(((.(((((((((..(((((((((((...((((.....))))(((((....))))).........(((((....))))).......((((....)))).........((((((((....((((((((((((((....((((((((..(((((((((((....(((((((((((((((...))))))))........))))).))....))))).))))))....((((.....))))...........((((..(........)..))))......))))))))....))))))).))))))).......((((.....))))..((((.((((((....))))))..))))))))))))...))))))))))).)))))).))).)))..)))))..))..)))))))))))).)))))))))))))).)))..(((((((...)))))))..))).))(....)
Thermodynamic Ensemble Prediction
(({({{{,({{(((((,(({{..,,,{({||{,,|,,|||}}}||..,{((({.((((((((.......(((((((((((.(((,,....,}},,,,.........(((((((((.......((((((((.(((.((((((......,.)))),....,).))).))))))))..{((((.((((..(((((((.((((((((.......),})))))))))))))..))))..))))}.((((,{,...,})))).....(({{((((...((((.(((((((.....))))))).))))))))))).((((({.......})).))))))))))))((((.(((((((((((.......)))))..))))))))))...))))))))))).......)))))))).))))){{,(({{{{|||,..(((((({(((..........{(((,(({{..,,}|||.{{{{{.||{(((((({{{,(((((,{.|||}},...,))}})))))).},||||||}},,.(((((.((.,,....}.)).)))))..,.......|||||,{(,,,(((({,....,.,}},,}}((((((((..,.,......((((((((((((((..........))))}})))))))))....(((((((((((((((....))).)).,,,,,.....{{{|,||||......,}))}.))))..)))))))))).,{((....))|{((..(((((.({..((((((....))))))}).))))).))}....(((((.{..{(..(((((.......,))))}}}..).))))).,,))))))))}||||.}}}.)}}}}}}}}})))))})||{(((((.(((((,((({.((,,,,||,,|}}},|||}}.}}))))||{((,,..}}))),.....,|,{||||.,,,)))))|.,},.,((((,..,)})),.......,||(((((({{{.((((((((((((((.,{.((((((((..((((({(((((....(((((((((((((({...})))))))........))))).))....))))).}))))).,,,((((,....}}},..,,,,...,{({{{..,.......,)..)))),,,}.,)))))))).}}.))))))).)))))))..,,.,..{{|||,...,,,..{{{{.{(((((....))))),..}}}}.,||||||{..,,,,))))))).,|}}}}..}},))).,}}.}}}}}}.,},}||||}})|}.}))}))))))))))}}}},,(((((({...))))))).,))),)}|}}}})
Forensic Context

No forensic context available.