Basic Information

Symbol
hsa_PAN3_0024200
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-PAN3_0120
Host gene
PAN3
Type of circRNA
Intron-Intron
Location (GRCh37)
13:28849871-28850610 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
13:28275734-28276473 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-182.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -199.82 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 155.34
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..((((.....(((.(((........))).)))....(((.(((((((((((.((.(((((...(((((((((((....((((((((((((((((((........))))))))))..))))))))........((((((.(..((...(....)...)).).)))))).....(((((((...............))))))))))))))))))..)))))...)).))))))).........................((((((..(((((((...((((((((...(((((.....((((..(((((.(((.(((.(((((((............((((...)))).((((.(.((((((.((((((((((((((((.(((((((((((((...(((((....(((....(((((((...((((((.......))))))......)))))))......)))...)))))....))))))))))))))))))))))))))))).)))))).).))))........(((((((.((..(((((((.....)))))))..((((((....))))))..(((..(((((((...)))))))..))))).)))))))(((((((((...))))))))).)).))))).))).))).).))))..))))))))))))))))))))))))..))))))...)))))))....((((.(((......))))))))))).........
Thermodynamic Ensemble Prediction
(.,{{{.{(((({(.(((........))).}},...,(((.(((((.,,{(({.((((.(((.((....}).))).))))|||||,.((((((((((........)))))))))).,{||||||||.......((((((.(..,,.,.{....}...,).).)))))}.....{{{{{{|...}}}},}}}},..,}}}}}},|||,...,,,.}}},,,..{(((({||{({..,,.....,,..)))}}}}}},..((((((..(((((((...(((((((((...{{{{.....{(({..{{{{|.{((,((,.(({{,,.......,{,,,.,{{,.,.}|||.((((.(.((((((.((((((((((((((((.(((((((((((((...(((((....{((....{((((((...((((((.......))))))......))))))}.....,}}}...)))))..,.))))))))))))))))))))))))))))).)))))).).))))..,,,..,,,,,,,,.{,,.(((((((.....))))))).,((((((....)))))),.{{{..(((((({...}))))))..},},},}))))}}||,,,(((({{{|||||||....,..))))})))})))...,}}},,)}))))))))))))))))))))))..))))))..))))))))...,)))).},....}{{{{{....,,,,....}}}})
Forensic Context

No forensic context available.