Basic Information

Symbol
hsa_PDS5B_0003800
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0100278 hsa_circPDS5B_006 hsa-PDS5B_0100
Host gene
PDS5B
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
13:33222891-33250096 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
13:32648754-32675959 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-240.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -260.25 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 287.16
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((.(((.((((((((((((.((.............)))).)))))))))).))).).)))))((((((((((..((..(((((..(((((((((((.......)))))((...(((((((....)))))))....)))))))).)))))...))..)))(((((((((((...((((((............))))))...)))).))))))).....((((((((.(((((((...(((((((.((.....(((((....)))))..)).))))))))))))))......((((..((((((((..((.((.....((((((((((.......)))).)))))).....))..))..))))))))..))))...(((((..((...........))..))))).....))))))))(((((((.((((.((((((......(((((((((((....(..(((((..(((...(((((.((.(((.((.((((((((..((((((((..........((((....(((((.....(((((((.(.((.((((.(((((((((..((((((((....))))))))..(((((.((((....)))))))))(((.((((.....)))).))).)))))))))..))))..)).)...))))))).)))))....))))..)))))))).....((((((....))))))........................))))))))))))).)))))))))))))))..)......)))))))))))...))))))(((((((((((((((.((((((...........(((.(((..((((........((((..............))))...))))..))).)))(((....((((....))))...)))...))))))))))))......)))))))))(((((........))))))))).)))))))...)))))))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((({.(((.((((((((((((,({..,,...,,...}),)),,))))))))).))}.,.))))}((((((({({..{({,{{{{{((,{{..,{{(({....,{{|{||{{({{{(((({{,..,,||}|||}....,},,},.|||,,,,...))},|{.(((((((((((...((((((............))))))...)))).))))))).,,},,}}|}}|{||||||,,...|||||||.{{,,...(((((....)))))..})})))))))))||)},....,.|(((..((((((((.,{,.{{...,.(((((({{((.......}))}.)))))).....}}..}},|))))))))..}}}}..,..,,|{(({{{{{{{{,,{(((((....,,,.))})))|}},,||||,,|||}|{((({((,,....|||||{|||||.,,,{..(((((,,|((...{((({.((.(((.((.((((((((..((((((((..........{(((,...{{,...{{(,{((((((.{.((.((((.(((((((((..((((((((....))))))))..(((((.((({....}))))))))(((.((((.....)))).))).)))))))))..))))..)).}...))))))))))))),...))})..)))))))).....((((((....))))))........................))))))))))))).))))))}}}}}))))..}.....,)}|||||}}}|.,,}}}}}},{{.{|||.|||||,}}}.,}}},,,||||{,.}}||||||.|{,||||,,,{.{{{{......,,,.,,.}))))}.,},,..||||||||(((....((((....))))...)))....,,,|||||}}}......}}}}}|,.|{||||,,,,....}}||||.,,}))),,}}}}.))})))).,
Forensic Context

No forensic context available.