Basic Information

Symbol
hsa_PDS5B_0003900
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0029941 hsa_circPDS5B_007 hsa-PDS5B_0089
Host gene
PDS5B
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
13:33222891-33253066 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
13:32648754-32678929 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-268.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -290.37 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 239.69
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((.(((.((((((((((((.((.............)))).)))))))))).))).).)).)).)((((((((...((....))...........(((((..((.(((((((((((.......((((((((((((......((((((((((((((((((.(((((((((((...((((((............))))))...)))).))))))).))))......((((((........)))))).(((((..((((((((((((((((...(((((((((((((.......)))))).((((((((.....(((((....((((....(.((((........)))).).....))))..))))).(((((....((((..(((((((((((..((((((........)))))).))..))))..))))).((((((......(((((((((((....(..(((((..(((...(((((.((.(((.((.((((((((..((((((((..........((((....(((((.....(((((((.(.((.((((.(((((((((..((((((((....))))))))..(((((.((((....)))))))))(((.((((.....)))).))).)))))))))..))))..)).)...))))))).)))))....))))..)))))))).....((((((....))))))........................))))))))))))).)))))))))))))))..)......)))))))))))...))))))...))))...)))))...........(((((....((((((.((.((((..............)))).)).)))))))))))..))))))))(((....((((....))))...)))..))))))).)))))).......((((..((((((........)))))).)))))))).))))))))))).)))))....)))))))))(((((.(((....))).)).)))...))))).))))))))))))....))))))))..))))).....)))))..)))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((,.(((.((((((((((((,({..,,...,,...}),)),,))))))))).))).,.)).)).)((({((((...,....,||,,.,....,,}(((((..((.((((((((((({,.....,{((((((((((......(((((((((((((({(((.(((((((((((...((((((............))))))...)))).))))))).}}},......((((((.,......)))))).(((((..(((((({{(((((((({{{(((({{(((((((.......))))))|(((((((,....,{,,,{.{{,{{{{,,|,,.....,,,,,||||}}....,}},,|||{||||||{(..,{....}....}||||.|,,||||||(((((........)))))||||{{{{|{{{{|{,{{(((,(({{,...|||||{|||||.}}},..,,,||}}|||...|||||.(({(((.((.((((((((..((((((((..........{(((,...{{,...{{(,{((((((.{.((.((((.(((((((((..((((((((....))))))))..(((((.((({....}))))))))(((.((((.....)))).))).)))))))))..))))..)).}...))))))))))))),...))})..)))))))).....((((((....))))))........................))))))))))))).)))}}},,,,}})))||},,...,|}||||||,||.,.||||||,{{,{{|,.|}}}},}}}.,}}},.,||||,..,}|||||{.{{,{{{,...,,,,,{.....,},}.,,.}))))},})},..})))))))(((....((((....))))...)))...}))))),}))))}..,....|||{,.((((((........)))))).}}}))))),))))))))))).))))),...}))))))))(((((.(((....))).)).)))...))))).)))))))))))),...,)))))))..)))}}.....))))}..)))
Forensic Context

No forensic context available.