Basic Information

Symbol
hsa_PDS5B_0004100
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0100279 hsa_circPDS5B_009 hsa-PDS5B_0019
Host gene
PDS5B
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
13:33222891-33284243 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
13:32648754-32710106 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-547.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -591.69 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 521.76
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((.(((.((((((((((((.((.............)))).)))))))))).))).).)))))(.(((((((....((((((..(((((...)))))..((((.((..(((((.(((((((....)))))))........((((.((((((((((((((.(((((((((((...((((((............))))))...)))).)))))))...........((((((((((...(((((((.((.....(((((....)))))..)).)))))))))))))....))))(((..((((((((..((.((.....((((((((((.......)))).)))))).....))..))..))))))))..))).........(((((((((((..((((((........)))))).))..))))..))))).((((((......(((((((((((....(..(((((..(((...(((((.((.(((.((.((((((((..((((((((..........((((....(((((.....(((((((.(.((.((((.(((((((((..((((((((....))))))))..(((((.((((....)))))))))(((.((((.....)))).))).)))))))))..))))..)).)...))))))).)))))....))))..)))))))).....((((((....))))))........................))))))))))))).)))))))))))))))..)......)))))))))))...))))))..))))))...)))...))))).)))))))))..)).)))).)))))))))))))...............(((((((.(((((.(((((((((((....((((....))))...)))....((((...((((((((.((((.....((((((........))))))...(((((((.....((((((((((((.((.((.(((((((.(((.......))).))))).))....((((..(((((((.....(((..(((((..(((((((....((((....)))).((((..((...((((....)))))).))))(((((((.((((((((...))))))))))))))).....))))))).))))).))).....(((((((.((.(((.((((......)))).))).)).)))).)))..)))))))..)))).((......)).)).)).))))))))))))........((..((((((.........(((((..........))))).........))))))..))........)))))))(((..(((((((....)))))))..))).(((((.....)))))..))))))))))))...)))).))))))))...................((((((((((..........((((((.((((((((..((((((.((((.....))))))))))(((((((((..(((((............)))))((((((((...)))))))).((((((...(((.(........).)))....)))))).)))))))))....)))).))))...)))))).......(((((.(((....))).))))))))))))(((....))).((((((((((.....(((.((.((.((((((...((........)).))))))..)))).)))(((......)))((((((..((((((.........))))))......(((((....))))).))))))....(((((((((.((((((......))))))...)))))))))))))))))))..........)))....))))).))))))).....((((((.(.........((((((...(((((((((((((.((((.((((((......(((....(((....((((((........))))))..)))....))).....)))))))))))))..))).)))))))...)))))).........).))))))((((...((((.(((......(((((....)))))........(((((((.................)))))))..))).))))....))))..)
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((,.(((.((((((((((((,({..,,...,,...}),)),,))))))))).))).,.)))))(.((((,((...(((((,{{{(({{{..,|||||..,,{({,{{{((({{{{({(((,..,,||}|||},...,},,|,.||{,,,,.,.}}|,{{.(((((((((((...((((((............))))))...)))).))))))).,,},|||||||{|||{(({{...{{(((((.((.....(((((....)))))..)).)))))))))}}}},...,|,|(((..((((((((.|{{.{{...,.(((((({(((.......)))}.)))))).....}}..}},|))))))))..)))}......,|||||,,..{{{,,{{((((....},,,))})))}}},.,{{((({{{|((((((((..,...{{(((((((((....{..(((((..{((...(((((.((.(((.((.((((((((..((((((((..........{(((,...{{,...{{(,{((((((.{.((.((((.(((((((((..((((((((....))))))))..(((((.((({....}))))))))(((.((((.....)))).))).)))))))))..))))..)).}...))))))))))))),...))})..)))))))).....((((((....))))))........................))))))))))))).)))))))))})))))..)......)))))))))||{{{|||({{.{{.((({{{{..,.,,|,.|||{{||||{{{,|,|{{||{,{{,{{{,...,,|,,,,....,}},.,,.||||||.||||..(((((((((((....((((....))))...)))....((((...(((((((((((((.....((((((........)))))).,,(((({((,,,..((((((((((({.,,.,{.(((({((,{({.,,,...}))},))})|}.....((((..(((((((.,,{,({{..(((((..(((((((....((((....)))}.||||.....,.((((....))))},,,,|.(((((((.((((((((...))))))))))))))).,...))))))).))))).,,,.,.||((({{{|.((.((({(,,,.....})))).))}.}}.}))}.))}..)))))))..)))).{{......}},}}.}),)))))))))))}........{{..{(((((.....,,..(((((..........))))).........))))))..))..,}....}})))},(((..(((((((....)))))))..))).(((((.....)))))..))))))))))))...)))).)))))))).............,,,,..,},||||,,{,..,|,,,..,|||||.,(((((,,..(((({((((((.....)))))))))).,,,|||||...||||,,.....}}}}})),)},||||,||},.,}}}}})))||||||},}|||,.,,,...{{|{|||{{{{||},,|{||||||||,...,)))},)))),..,}},,|{{{{...(((((.(((....))).)))))))))).|{{{....)))}((((((((((,....{{{.((.{{.{{((((...((........}}.)))))}..)}}).))){|},,,|,..,}|||{((.,((((((.,,.,,....|||||....,}}||,|,.}}),}}.,)))))).,..{((((((((.((((((......))))))...))))))))))))))))))|{{{{{((((.....)))))),,}))),,|,.,,...,,|||}|.....,,..{{((((...((((((((((((,{((((.((((((...,,.(((....(((....((((((........))))))..)))....))).,...)))))))))))))..))),}))))))...))))))......}}})})),,})||}....|}}.,,,{{,,,,.(((((,,..}))))..,.....||||||,.....,.,,,.},....}}}}}},,}}}}})))..,}.))))..)
Forensic Context

No forensic context available.