Basic Information

Symbol
hsa_PDS5B_0006800
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0029946 hsa_circPDS5B_014 hsa-PDS5B_0091
Host gene
PDS5B
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
13:33232376-33253066 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
13:32658239-32678929 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-174.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -189.18 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 203.97
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Forensic Context

No forensic context available.