Basic Information
Symbol
hsa_PDS5B_0006900
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0100281
hsa_circPDS5B_015
hsa-PDS5B_0096
Host gene
PDS5B
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
13:33232376-33258160
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
13:32658239-32684023
UCSC (hg38)
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-211.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-228.66 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
223.09
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((......(((((......)))))((((((((((((...(....)....))))).)..)))))).((((........))))((((((((((((((((.(((((.(((((...))))).))))).)))......)))))))...))))))((((((.((.((((((((..((((((((..........((((....(((((.....(((((((.(.((.((((.(((((((((..((((((((....))))))))..(((((.((((....)))))))))(((.((((.....)))).))).)))))))))..))))..)).)...))))))).)))))....))))..)))))))).....((((((....))))))........................)))))))))))).))))........))))..((.((((((.(((((.((...(((((((((.(((........))).))))..)))))...)))))))((((((((.(((((((((..(((...(((.......)))...)))...))))(((....((((....))))...))).........))))).))))....))))..((((((........))))))....(((((((((.....(((((((((....(((((((.((........)).))).))))...))))))))))).)))))))((((..((((((((..(((((((....((((....)))).((((..((...((((....)))))).))))(((((((.((((((((...))))))))))))))).....))))))).))))........))))..))))((.(((((........))))).))..........)))))))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
(({(.,,...(((({......||}||(((({,{(((((...{....)....))))).}..}||}}|{((((........))))||{{{{((((((((((.(((((.(((({...|)))),|}})).}}},.....|))))))...|||||.(({(((.((.((((((((..((((((((..........{(((,...{{,...{{(,{((((((.{.((.((((.(((((((((..((((((((....))))))))..(((((.((({....}))))))))(((.((((.....)))).))).)))))))))..))))..)).}...))))))))))))),...))})..)))))))).....((((((....))))))........................))))))))))))),))),,,,,},,))))..{{.{{{{{||({((|,{{...(((((({((.(((,.,,,,,.}}}.}}}}..|}||},,.||||||||,({{(({.{{{{{((((....,...,,,,..}}}}..,,.,|||,{{|}}}{((..,.{(((,,,.}}}}..,))),,...,,}.})))),.,,|{,,,|||{..((((((........))))))....(((((((((,....{((((((((.,,.{{{((((.((........)).)))),))).,.))))))))))),})))))){{{||,|{{{((((..{((((({.,.,{(({...,)))).||||.,,,,,.((((....))))},|}},.(((((((.((((((((...))))))))))))))).}.,,))))))}.))))}..,,,,.}}||{,|||,((.((({(,,......})))).))}.},.}},,.)))}}}}),
Forensic Context
No forensic context available.