Basic Information

Symbol
hsa_PDS5B_0010100
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0100287 hsa_circPDS5B_022 hsa-PDS5B_0101
Host gene
PDS5B
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
13:33247353-33262706 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
13:32673216-32688569 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-179.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -194.42 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 161.94
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.((((((((((.(((((...(((.(((((((((.....((((((...(((((((.....)))))))(((((.(((........))).))))).......)))))).....)))))).))).)))...............)))))..))))..(((((((((((....((((....))))...)))....((((...((((((((.((((.....((((((........))))))...(((((((.....((((((((((((.((.((.(((((((.(((.......))).))))).))....((((..(((((((.....(((..(((((..(((((((....((((....)))).((((..((...((((....)))))).))))(((((((.((((((((...))))))))))))))).....))))))).))))).))).....(((((((.((.(((.((((......)))).))).)).)))).)))..)))))))..)))).((......)).)).)).))))))))))))........((..((((((.........(((((..........))))).........))))))..))........)))))))(((..(((((((....)))))))..))).(((((.....)))))..))))))))))))...)))).)))))))).....)))))).(((((..(((.((....((.((((.....)))).))..)))))..........)))))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
.,((((,(((..((((((..(((.(((((((((.....((((({...{{{((((,,.,,}},||||(((((.(((........))).))))}..}}}}.,,)))),,,,.)))))).))).))),,,..||,..,,,,,}},,,...,,,..(((((((((((....((((....))))...)))....((((...(((((((((((((.....((((((........)))))).,,(((({((,,,..((((((((((({.,,.,{.(((({((,(({.,,,...}))},))})|}.....((((..(((((((.,,{,({{..(((((..(((((((....((((....)))}.||||.....,.((((....))))},,,,|.(((((((.((((((((...))))))))))))))).,...))))))).))))).,,,.,.||((({{{|.((.((({(,,,.....})))).))}.}}.}))}.))}..)))))))..)))).{{......}},}}.}),)))))))))))}........({..((((((.....,,..(((((..........))))).........))))))..))..,}....}})))},(((..(((((((....)))))))..))).(((((.....)))))..))))))))))))...)))).))))))))..,,,,,.....,.}))))).}}}}}}}.{{,((((.....|}}}.,|{{,,,,},,,..,,.},,)))),.
Forensic Context

No forensic context available.