Basic Information

Symbol
hsa_PDS5B_0010200
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0100288 hsa_circPDS5B_023 hsa-PDS5B_0044
Host gene
PDS5B
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
13:33247353-33284243 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
13:32673216-32710106 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-367.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -396.56 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 330.18
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((........))(.(((((((..(((((((.(.(((.((((.(((((((.((((((.((...(((((((((.(((........))).))))..)))))...)))))))).............(((((..(((((....(((((((.(((((.(((((((((((....((((....))))...)))....((((...((((((((.((((.....((((((........))))))...(((((((.....((((((((((((.((.((.(((((((.(((.......))).))))).))....((((..(((((((.....(((..(((((..(((((((....((((....)))).((((..((...((((....)))))).))))(((((((.((((((((...))))))))))))))).....))))))).))))).))).....(((((((.((.(((.((((......)))).))).)).)))).)))..)))))))..)))).((......)).)).)).))))))))))))........((..((((((.........(((((..........))))).........))))))..))........)))))))(((..(((((((....)))))))..))).(((((.....)))))..))))))))))))...)))).))))))))...................((((((((((..........((((((.((((((((..((((((.((((.....))))))))))(((((((((..(((((............)))))((((((((...)))))))).((((((...(((.(........).)))....)))))).)))))))))....)))).))))...)))))).......(((((.(((....))).))))))))))))(((....))).((((((((((.....(((.((.((.((((((...((........)).))))))..)))).)))(((......)))((((((..((((((.........))))))......(((((....))))).))))))....(((((((((.((((((......))))))...)))))))))))))))))))..........)))....))))).))))))).))))))))))..)))))))..((((((...(((((((((((((.((((.((((((......(((....(((....((((((........))))))..)))....))).....)))))))))))))..))).)))))))...))))))...........((((.((((......((.(((......(((((....))))).......))).)).......))))))))....))))))).).)))))))..))))))).)
Thermodynamic Ensemble Prediction
((........))(.(((((((..(((((((.,.(((.(({,,((((((((((((((.((,{{({(((({((.(((,,,,....}}}.}}|||,|||||,..}}||||||,{(.{{,....,,{{{{{...,|||,.,,,||||||.||||..(((((((((((....((((....))))...)))....((((...(((((((((((((.....((((((........)))))).,,(((({((,,,..((((((((((({.,,.,{.(((({((,{({.,,,...}))},))})|}.....((((..(((((((.,,{,({{..(((((..(((((((....((((....)))}.||||.....,.((((....))))},,,,|.(((((((.((((((((...))))))))))))))).,...))))))).))))).,,,.,.||((({{{|.((.((({(,,,.....})))).))}.}}.}))}.))}..)))))))..)))).{{......}},}}.}),)))))))))))}........({..((((((.....,,..(((((..........))))).........))))))..))..,}....}})))},(((..(((((((....)))))))..))).(((((.....)))))..))))))))))))...)))).))))))))...............,,..,},|{||,,{,..,|,,,,.,{||||.{(((((,{..(((({((((((.....)))))))))),,{,|||||...||||,,.....}}}},))})|{||||,||},,},)))))))|{{|||...||{.,{,,...{{|{|||{{{{|},},|{||||||||,...,)))},)))),..,}}},|{{{{...(((((.(((....))).)))))))))).|(({....)))}{(((((((((,....{{{.((.{{.{{((((...((........}}.)))))}..)}}).))){|},,,|,..,}|||{((.,((((((.,,.,,....|||||....,}}||,|,.}}),}}.,)))))).,..{((((((((.((((((......))))))...))))))))))))))))))|{{{{(((((.....)))))),,}))),,}|.,},,.,,})}}},,,,,}}..{(((((...((((((((((((,{((((.((((((...,,.(((....(((....((((((........))))))..)))....))).,...)))))))))))))..))),}))))))...)))))}......,}}}}||,,}||||....|}}....{{{{{{,(({(({{..,)))),,}.....}}}))}......,,},,}}}....})))})).}.)))))))..))))))).)
Forensic Context

No forensic context available.