Basic Information

Symbol
hsa_PDS5B_0013100
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0100290 hsa_circPDS5B_028 hsa-PDS5B_0020
Host gene
PDS5B
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
13:33258015-33284243 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
13:32683878-32710106 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-265.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -287.72 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 207.88
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((.(((....((((((...((((....((((.((((((((.((((((((...))))))))))))))..((((((((.....(..((((((((..(((((((.((.(((.((((......)))).))).)).)))).))).......))))))))..)...(((((.(((.((((.....)))).............))))))))......))))))))......(((((((......).))))))(((((...............(((..(((((((....)))))))..))).(((((.....)))))...))))))).))))...))))...)))))).....))).)))......(((.((....((.((((.....)))).))..)))))......((((((.....))))))((.(((..((((((((.(((....((((((((...(((((((.(((......))).)))))))........(((...((((((((((((....((((((((((....)))).)))))).......(((((...(((((.(((....))).)))))))))).((((....)))).(((((((((.....(((.((.((.((((((...((........)).))))))..)))).)))(((......)))((((((..((((((.........))))))......(((((....))))).))))))....(((((((((.((((((......))))))...))))))))))))))))))((((((((((.....))))))..))))..(((((.....))))).........((((((...(((((((((((((.((((.((((((......(((....(((....((((((........))))))..)))....))).....)))))))))))))..))).)))))))...))))))......)))))))..)))))....)))....(((((((((.((((...))))))).....))))))........)).)))).....))....)))))))))))..)))..))
Thermodynamic Ensemble Prediction
{((.(((.,{.((((((...((((....((((.{(((((((.((((((((...))))))))))))))}.((((((((..{{((.{((((((({,.(((((((.((.(((.((({......)))).))).)).)))).))).....,,||,,,}|..,{......,},||..((((.....)))).......,}}}}}))).))))....,.))))))))......(({((({......}.}}))}}{((((...{,{,...,|},.(((..(((((((....)))))))..))).{{{{{....,)))}}...)))))}).))))...))))...))))))..,,.))).})).,.({.{.((((...,((.{{{{.....}))),,|{{,..}},{{({,((((((.....))))))})}}....((((((((.,((....{.((((((...{((((((.(((......))).)))))))....|,..(({...((((((((((((,...((((((((({....}))),})))))....,..(((((...(((((.(((....))).)))))))))).{(({....}))},(((((((((,....{{{.((.{{.{{((((...((........}}.)))))}..)}}).))){|},,,|,..,}|||{((.,((((((.,,.,,....|||||....,}}||,|,.}}),}}.,)))))).,..{((((((((.((((((......))))))...))))))))))))))))))((((((((((.....))))))..))))..,,........,}|||.....,,,.,{((((...((((((((((((,{((((.((((((...,,.(((....(((....((((((........))))))..)))....))).,...)))))))))))))..))),}))))))...))))))......}))))))..)))))....))).,..{(((((,(({((((...)))),,).....)))))}........)),,)))...}}}}....}},)))))))))))).,.))
Forensic Context

No forensic context available.