Basic Information

Symbol
hsa_PDS5B_0013200
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0100291 hsa_circPDS5B_029 hsa-PDS5B_0057
Host gene
PDS5B
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
13:33258015-33334858 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
13:32683878-32760720 UCSC (hg38)
External Database
circbank circBase

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-607.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -656.16 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 577.37
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((.(((....((((((...((((....((((.((((((((.((((((((...))))))))))))))..((((((((.....(..((((((((..(((((((.((.(((.((((......)))).))).)).)))).))).......))))))))..)...(((((.(((.((((.....)))).............))))))))......))))))))......(((((((......).))))))(((((...............(((..(((((((....)))))))..))).(((((.....)))))...))))))).))))...))))...)))))).....))).))).......(..((..((((...........))))..))..)(((((((...((((((....((((((...(((((((((..(((((............)))))((((((((...)))))))).((((((...(((.(........).)))....)))))).)))))))))....((((((((((.......(((((...(((((.(((....))).)))))))))).((((....)))).(((((((((.....(((.((.((.((((((...((........)).))))))..)))).)))(((......)))((((((..((((((.........))))))......(((((....))))).))))))....(((((((((.((((((......))))))...))))))))))))))))))((((((((((.....))))))..))))..(((((.....))))).........((((((...(((((((((((((.((((.((((((......(((....(((....((((((........))))))..)))....))).....)))))))))))))..))).)))))))...)))))))))))))))).(((((((((........((((((((..(((((....))))).......(((((((.....(((((((((((..((((.(((((...))).....))...))))..)))))))))))......................((......))((((.((((((..........(((((((....(((((((.((((.((((((((((..(((((.(((((((((((..((((.(((((............(((((((.(((((.....(((.....((((.(((...))).)))).......(((((((((((...((((..(((((.............(((((((.((((..(((((...)))))(((((((....))).)))))))).))))))).............((...((((..(((((..((((((...((((((..(((((((((....((.((((((((...)))))))).)))))))).))).......................))))))))))))..........(((.............)))..(((((((.....((....(((((((..............(((((.......)))))...((((.((((((...(((....)))...))))))))))..)))))))..)).....)))))))...............(((((((((..((((..(((....)))..))))..........((((((...(((...((((..................))))..)))...)))))).))))))))).))))).))))...))))))).)))).))).))))))))..)))......)))))...)))))))............)))))))))..))))))))..((((((.....)))))).)))..)))))...))))))).))).)))).))))))).....)))))))......))))))...)))).......(((((.........))))).((((((.(((((((((((....))))))))))).))))))))))))).....(((((...........((((((......((((((((......))))))))..........................((((.((((((((.......(((.((((((((.....((((((((((.(((((.(((((......))))).)))....)).))))))))))..(((...)))....((.(.(((...))).).)))))).)))).)))..((((........))))...........))))))))..))))((((((....))))))...(((((((((..................)))))))))))))))...))))).)))))))).))))))))).....(((.(((..((.....)).)))...)))....))))))..))))))....)))))))..(((((((..........)))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((.(((.,,.((((((...((((....((((.{(((((((.((((((((...))))))))))))))}.((((((((..{{{(.{((((((({,.(((((((.((.(((.((({......)))).))).)).)))).))).....,,||,,,}|..,{......,},||..((((.....)))).......,}}}}}))).))))....,.))))))))......(({((({......}.}}))}}{((((...{,{,...,|},.(((..(((((((....)))))))..))).{{{{{....,)))}}...)))))}).))))...))))...))))))..,,.))).}}}.......((((,...,((,,,.,,,.((((({,{((((({(..((((,{{((((.....))))))}}}}{((((((((..,((((............))))|((((((({...,))))))),((((((...(((.{........).)))....)))))).)))))}}}}|,..}|||,||||,..}}}}}|,|||...(((((.(((....))).)))))}}|||.{{{{,...)}}},{,,(((((((..{((((.{,.,,.{((({{...((,,...,..||,||||||..},,},}}|||},,||}..{|{{{,((.{((((((.,{.{{....{{|||....})}||,{..,,},}}.})))))).,..(((((((((.((((((......))))))...))))))))),}}}}))))((((((((((.....))))))..)))),,}},,,.....,|||{.....||,..{((((...((((((((((((,{((((.((((((...,,.(((....(((....((((((........))))))..)))....))).,...)))))))))))))..))),}))))))...))))}|{{{{{{...(((((((,(,,....{((((({((,{{,.(((((,,..}))))..,......,,........(((((((((((..((((.{{{((...,,,.....))...))))..)))))))))))}}}.)))),....}}},.....||,...,,},}.})))))}...}}},,|}}||{{{{{,...||||||||{{{{(.,,,.}||||.((((.((((...(({.,,,,,(.((((.....)))),}},,)))...)))).))))..}})))..}}}}}}|..}||,....((((((((...(((.......)))..)))))))).,((((({.,,,,....(((((((.((((..,{(((,,{||||,{,,,|||,}},))),)),,)))).)))))))..,,}.........{{{|((||.,,}}}.,.((((((...((((((.,(,,{{(({{....((.((((((({...}))))))).)))))))|,|||..,{........,),.,}},...)))))))))))).,,,..,,{{(({{.{{{..,,,,||,|||.((((((|.....{((((.....|(|.............)).,...))))).((((((((((((((((((((((.(((.(((((((((((({,.,.{{((,.((((,,..((,...,,|({{{,.,{..........,|||}}}}...{(((..(({....)))..)))},},.}},.}))}.).})))),))))...)))))))).))),,)}}||(....}}|,(((({(((..(((((.((((.....))))...)))))..)))((((((((.(((((((((((((((.((((..(((((((((......))))))...)))..)))).)))).)))..{(((((.....)))))|{(({{....})}}}.)))))))).{{{({({,,(({{{.....,,))))}....,|||||}.({((((......}))))),,...))))))))...((((((.(((((((((((....))))))))))).))))))})))}.......{((((.....,.....{{{{{{,.....((((((((......))))))))..........................((((.((((((((.......{{{.((((((((,{,..{(((((((((.,.(((.(((((......))))).)))....},,)))))))))),|((,...}})....{{.,.(((...})).}.,}}}}},}}}}.}}}..{{{{........)))}...........))))))))..)))){{{{((,,,.}}}}))}},(((((((({.................,)))))))))))))}}.,.))))}.......)))))}}))))...))))))))....}))))))..})).)}..))).}))))),}.}))))))},....))))..,||(((((..........}})))))
Forensic Context

No forensic context available.