Basic Information

Symbol
hsa_PDS5B_0014200
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0100293 hsa_circPDS5B_032 hsa-PDS5B_0111
Host gene
PDS5B
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
13:33261271-33320238 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
13:32687134-32746100 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-376.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -407.17 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 380.89
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((((((((((.((.(((((((.((((.....)))).............((((((.........(((((..........))))).........))))))((.((((((..........(((..(((((((....)))))))..))).(((((.....))))).....)))))).))....))))))).))................(((...((((((((((......((((((((...(((((....((((((.((((.....))))))))))....)))))..(((((............)))))((((((((...)))))))).((((((...(((.(........).)))....))))))(((((((((....)))).)))))........(((((...(((((.(((....))).)))))))))).((((....)))).(((((((((.....(((.((.((.((((((...((........)).))))))..)))).)))(((......)))((((((..((((((.........))))))......(((((....))))).))))))....(((((((((.((((((......))))))...))))))))))))))))))((((((((((.....))))))..)))).........))))))))..........((((((.......((((.((.(((((((((((..((..(((((......)))))(((((........)))))...))))))))))))).))))))))))))))))))))))..)))..(((..((((((((...(((((((.(......(((((((((.(((.(((((....)))))...................(((((((((((..((((.(((((...))).....))...))))..)))))))))))))).)))))....)))).....((......))).)))))))...)))..))))).))).....)))).)))))))))((...((((.((((.((((...(((.....((.((((.....)))).))..)))...)))).))))....)))).......((..((.....((((((((...(((.......)))..))))))))........))..))...(((((((.((((..(((((...)))))(((((((....))).)))))))).)))))))...............(((((...)))))...((((((...((((((..(((((((((....((.((((((((...)))))))).)))))))).))).......................)))))))))))).......(((.(((((..(((((((((..(((((.(((.((.((.(..((((((((..............(((((.......)))))...((((.((((((...(((....)))...))))))))))..))))))).)..).)).)).))))))))...))))))......)))...))))).))).))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((((((((((.,(,{((((((.((((.....))))....,....,...{{{{{{.....,,..(((((..........))))).........|(((,{(({(..,(,{,....,,..(((..(((((((....)))))))..))).{{(((....,)))}}...}}))).))}),....))))))}.}|.........|....,.......{{{({,{,,{,.,{,,{{.(((({{.{(((((,{..(((({((((((.....)))))))))),,{,|||||..,((((............))))|((((((({...,)))))))}((((({...(({.,........}.)))....)))))){||||||||,....}}}|,)))},..,,},,|{{{{...(((((.(((....))).)))))}}}}}.{{{{....)}}},(((((((((,....{((.((.{{.{{((((...((........}}.)))))}..}}}).)}){|},,,|,..,}|||{((.,((((((.,,.,,....|||||....,}}||,|,.}}),}}.,)))))).,..{((((((((.((((((......))))))...))))))))))))))))))((((((((((.....))))))..))))............}}}}}.....,,..,{((((...((((((((((((,{((((.((((((...,,.(((....(((....((((((........))))))..)))....))).,...)))))))))))))..))),}))))))...)))))}},,|||,,,|((((((.(,.....{((((({((,{{,.(((((,...}))))...................(((((((((((..((((.{{{((...,,,.....))...))))..)))))))))))})}.)))),....}}},.....((.....,},).))))))).,})})},.}})))}})}))..)))).)))))))))((...{{{,.((((.((((...(({.,,,{,(.((((.....))))})},,)))...)))).))))..,,|||,..,,{.{{{..{{|,...((((((((...(((.......)))..))))))))..},,,,,,,,,,....(((((((.((((..,{(((,,,|||},{{,,{||.,,,))),)),,)))).)))))))..,,}....,,.,.,,,}})}}},,)}}}|.((((((...((((((.,(,,{{(({{....((.((((((({...}))))))).))))))}|,|||..,{........,),.,}},...)))))))))))).......(({.(((({..,,,{(((((..({((({(((.,,.,(,....(((((((........,,...{(((,{...,{,.|}}}}.,|((({,{{{{|{..,|{{,..,))}...))))))))),..)))))))..,,..,,.))})))),,}}...}}})))..,,..}}},..})))).})).))
Forensic Context

No forensic context available.