ForensicRNA
Home
Atlas
Index
Marker Scope
|
About
Feedback
ForensicAgent
Home
Index
hsa_PDS5B_0016200
Basic Information
Symbol
hsa_PDS5B_0016200
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0100296
hsa_circPDS5B_036
hsa-PDS5B_0007
Host gene
PDS5B
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
13:33268360-33281176
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
13:32694223-32707039
UCSC (hg38)
External Database
circbank
circBase
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-130.10
kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-139.01
kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
70.46
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
COPY
((((((((..(((((((((..(((((............)))))((((((((...)))))))).((((((...(((.(........).)))....)))))).))))))))).....(((((....)))))..(((((...(((((.(((....))).)))))))))).((((....))))((((((((((.....(((.((.((.((((((...((........)).))))))..)))).)))(((......)))((((((..((((((.........))))))......(((((....))))).))))))....(((((((((.((((((......))))))...)))))))))))))))))))....(((((.....)))))))))))))((((.........(((.....))).....(((((((.(...(.((....)).).).))))))).(((((......)))))(((((........)))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
COPY
((((((({.{(((((((((..,((((............))))|((((((({...}))))))),((((((...(((.{........).)))....)))))).))))))))))}...(((((....)))))..(((((...(((((.(((....))).)))))))))).((((....))))((((((((((,....{{{.((.{{.{{((((...((........}}.)))))}..)}}).))){|},,,|,..,}|||{((.,((((((.,,.,,....|||||....,}}||,|,.}}),}}.,)))))).,..{((((((((.((((((......))))))...)))))))))))))))))))...,(((((.....)))))))))))))((((.........{{,.....}},...,.(((((((.(...{.{{....))...).))))))).(((((......)))))(((((........)))))))))
Forensic Context
No forensic context available.