Basic Information

Symbol
hsa_PDS5B_0016500
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0029953 hsa_circPDS5B_039 hsa-PDS5B_0025
Host gene
PDS5B
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
13:33268360-33309467 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
13:32694223-32735330 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-242.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -261.84 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 176.29
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((.....(((.((......)).))).....))))(((((((((((((((...)))))))))((((((...(((.(........).)))....))))))(((((((((....)))).)))))................(((((.(((....))).)))))..(((((((.(((..((.(((((((((((..(((((.......(((((((..((((...((.(((..((((.....)))))))))))))..(((((.((.(((((((.((.((....(((((....)))))....))..)).))))))).)).(((((((((.((((((......))))))...)))))))))....)))))((((((((((.....))))))..))))))))))).......(((.....)))..(((((...(((((((((((((.((((.((((((......(((....(((....((((((........))))))..)))....))).....)))))))))))))..))).)))))))...)))))(((((((...(((((((.(......(((((((((.(((.(((((....)))))...................(((((((((((..((((.(((((...))).....))...))))..)))))))))))))).)))))....)))).....((......))).)))))))...)))..))))((((((....))))))..(((((.....))))).((((.((((...(((.....((.((((.....)))).))..)))...)))).))))..)))))..)))))))...(((....((((((((...(((.......)))..))))))))..)))(((((............)).))).........))))...))..)))))))))))).))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((.....(((.((......)).))).....))))((((({(((((((({...}))))))))((((((...(((.{........).)))....))))))(((((((({....}))),}))))................(((((.(((....))).)))))..{((((({{(({..{{,{{..(((((((..(((((.,..,..(((({{,..(({{...,..{{{{{{{{{,,,..,}},|||},,||},.{{{{(,{{.{((((((.,{.{{....{{||{....}))||,{..,,}})}.})))))).,..(((((((((.((((((......))))))...))))))))).,,,}}})}((((((((((.....))))))..))))}}}}}}}......,|{{.....}},..,((((...((((((((((((,{((((.((((((...,,.(((....(((....((((((........))))))..)))....))).,...)))))))))))))..))),}))))))...))))|((({(((...(((((((.(......(((((({((,{{,.(((((,...}))))...................(((((((((((..((((.{{{((...,,,.....))...))))..)))))))))))})}.)))),....}}},.....((......},).)))))))...)))..})))|{{(({,,..}}}))),,{((((.....))))}.((((.((((...(({.,,,,,(.((((.....))))}}},,)))...)))).))))..)))))..)))))))..,|,,....((((((((...(((.......)))..))))))))..{{{(((,,...,........))})))..{{{{{,..,))))}),..))))))))))}).))))
Forensic Context

No forensic context available.