Basic Information

Symbol
hsa_PDS5B_0016900
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0100302 hsa_circPDS5B_043 hsa-PDS5B_0008
Host gene
PDS5B
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
13:33268360-33334858 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
13:32694223-32760720 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-508.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -549.75 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 460.85
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((.(((...(((((((((..(((((............)))))((((((((...)))))))).((((((...(((.(........).)))....)))))).))))))))).....(((((....)))))..(((((...(((((.(((....))).)))))))))).((((....))))((..(((((((..(((((.......(((((((..((((...((.(((..((((.....)))))))))))))..(((((.((.(((((((.((.((....(((((....)))))....))..)).))))))).)).(((((((((.((((((......))))))...)))))))))....)))))((((((((((.....))))))..))))))))))).......(((.....)))..(((((...(((((((((((((.((((.((((((......(((....(((....((((((........))))))..)))....))).....)))))))))))))..))).)))))))...)))))(((((((...(((((((.(......(((((((((.(((.(((((....)))))...................(((((((((((..((((.(((((...))).....))...))))..)))))))))))))).)))))....)))).....((......))).)))))))...)))..))))((((((....))))))..(((((.....))))).((((.((((...(((.....((.((((.....)))).))..)))...)))).))))..)))))..)))))))..))......((((((((...(((.......)))..))))))))((((((((.........(((((((.((((..(((((...)))))(((((((....))).)))))))).)))))))..............(((.((((.........((((((...((((((..(((((((((....((.((((((((...)))))))).)))))))).))).......................)))))))))))))))).)))((((((.(((......((.(((.((((((......(((((......((.............)).....))))).((((((((((((((((((((((.(((.((((((((((((.....(((((.((((.........(((((......((......))(((((.......)))))......))))).((((....)))).)))).).))))..))))...)))))))).))))))).(((....))).((((((((..(((((.((((.....))))...)))))..)))((((((((.(((((((((((((((.((((..(((((((((......))))))...)))..)))).)))).)))..((((((.....))))))(((((....))))).)))))))).((((((...(((((.......))))).....)))))).((((((......)))))).....))))))))...((((((.(((((((((((....))))))))))).))))))))))).......(((((...........((((((......((((((((......))))))))..........................((((.((((((((.......(((.((((((((.....((((((((((.(((((.(((((......))))).)))....)).))))))))))..(((...)))....((.(.(((...))).).)))))).)))).)))..((((........))))...........))))))))..))))((((((....))))))...(((((((((..................)))))))))))))))...))))).......))))).)))))...)))))))).....))))))..))).))..))).))))))...))))))))........))))))(((((............)))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((.(((..{(((((((((..,((((............))))|((((((({...,)))))))}((((((...(((.{........).)))....)))))).)))))))))}}...((((({{{,.,,,|..(((((...(((((.(((....))).)))))))))).|{{{....}))}|{{,(((((((..{((((.,,.,,.{((({{...((,,...,..||{||||||..|,,},}}|||},,||}..{|{{{,((.{((((((.,{.{{....{{|||....})}||,{..,,},}}.})))))).,..(((((((((.((((((......))))))...))))))))),}}}}))))((((((((((.....))))))..)))),,}}}},.....,}|||.....,},..{((((...((((((((((((,{((((.((((((...,,.(((....(((....((((((........))))))..)))....))).,...)))))))))))))..))),}))))))...))))}||{|{{|,..(((((((.(,.....{((((({((,{{,.(((((,...}))))...................(((((((((((..((((.{{{((...,,,.....))...))))..)))))))))))})}.)))),....}}},.....{{.....,},}.)))))))...}}),,}}})|{{{{{,,..|||}}}||{{{{(.,,..}}}}}.((((.((((...(({.,,,,,(.((((.....))))}}},,)))...)))).))))..}})))..}}}}}}}..,|,,....((((((((...(((.......)))..)))))))).,((((((.{{{,....(((((((.((((..,{(((,,{||||,{,,,|||,}},))),)),,)))).)))))))...,,.........{(({(({{.,,}},...((((((...((((((.,(,,{{(({{....((.((((((({...}))))))).)))))))|,|||..,{........,),.,}},...)))))))))))),,,,.,,,((((((.{{{......{(.(((.((((((|.....(((((.....,({.............)).,...))))).((((((((((((((((((((((.(((.(((((((((((({,...{{((,.((((,,..((,...,,|({{{,.,(..........,|||}}})...{(((..(({....)))..)))}}},.}},.}))}.).})))),))))...)))))))).))),,))}||(,...|||.((((((((..(((((.((((.....))))...)))))..)))((((((((.(((((((((((((((.((((..(((((((((......))))))...)))..)))).)))).)))..{(((((.....)))))|{(({{....})}}}.)))))))).{{{{{({,,(({{{.....,,))}}}....,}|||||.({((((......}))))),,...))))))))...((((((.(((((((((((....))))))))))).))))))})))}.......{((((.....,.....{{{{{{,,....((((((((......)))))))).....................,....((((.((((((((.......{{{.((((((((,,,..{(((((((((.,.(((.(((((......))))).)))....},,)))))))))),|((,...}})....{{.,.(((...})).}.,}}}}},}}}}.}}}..{({{........))))...........))))))))..)))){{,{((,,,.}}}}))}},(((((((({.................,)))))))))))))}}.,.))))}.......)))))}}))))...))))))))....,))))))..))).))..))).)))))).,.))})))))}.......))))))(((((............)))))
Forensic Context

No forensic context available.