Basic Information

Symbol
hsa_PDS5B_0019100
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0029954 hsa_circPDS5B_045 hsa-PDS5B_0106
Host gene
PDS5B
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
13:33275460-33284243 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
13:32701323-32710106 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-94.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -101.38 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 51.29
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((...............(((((....)))))((((.(((....((((((((.((((((......))))))...)))))))))))...))))((((((((((.....))))))..)))).....(((.((((((.(.........((((((...(((((((((((((.((((.((((((......(((....(((....((((((........))))))..)))....))).....)))))))))))))..))).)))))))...)))))).........).)))))).)))..)))(((((((.....(((((....)))))........(((((((.................)))))))(((...)))...)))))..))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((......,,{.....,|((((....)))),{(((.{{....(((((((((.((((((......))))))...))))))))),}...)))}((((((((((.....))))))..)))),,,,.{({.((((((.{.........((((((...((((((((((((,{((((.((((((...,,.(((....(((....((((((........))))))..)))....))).,...)))))))))))))..))),}))))))...)))))).........}.)))))).}}}..)))(((((((.....(((((....)))))........{(((({,...........,.....}))}}}}(({...)))...))))}.,))
Forensic Context

No forensic context available.