Basic Information

Symbol
hsa_PDS5B_0019200
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0029955 hsa_circPDS5B_046 hsa-PDS5B_0040
Host gene
PDS5B
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
13:33275460-33309467 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
13:32701323-32735330 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-161.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -177.09 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 134.54
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(((..............(((((....)))))((((.(((....((((((((.((((((......))))))...)))))))))))...))))((((((((((.....))))))..))))..........((((.((.((((((((((((((((.(((((((((((((.((((.((((((......(((....(((....((((((........))))))..)))....))).....)))))))))))))..))).)))))))..(((..((((((((...(((((((.(......(((((((((.(((.(((((....)))))...................(((((((((((..((((.(((((...))).....))...))))..)))))))))))))).)))))....)))).....((......))).)))))))...)))..))))).))).)))))..((.....)).......((((.((((.((((...(((.....((.((((.....)))).))..)))...)))).))))....)))).....(((...)))..))))))))....))).))..)))))))(((((((....((((((..............))))))..((((((...))))))...(((....))))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((.....,,{..,..,|((((....)))),{(((.{{....(((((((((.((((((......))))))...))))))))),}...)))}((((((((((.....))))))..)))),,,,,.......{{|{{.....{{,.,{((((...((((((((((((,{((((.((((((...,,.(((....(((....((((((........))))))..)))....))).,...)))))))))))))..))),}))))))...))))}||,,,,|...(((((((.(......(((((({((,{{,.(((((....}))))...................(((((((((((..((((.{{{((...,,,.....))...))))..)))))))))))})}.)))),....}}},.....((......},).)))))))..,))){{.,||{{{{{{,,,,||,||},,,,,,,.,,..,(({{.((((.((((...(({.,,,{,(.((((.....)))),)},,)))...)))).))))....}))}...,,,{{...})),,,.{{((((({...{((.......)))..})))))}}..((((((..............))))))..{(((({...}))))},,,,{{....)))}))}}))
Forensic Context

No forensic context available.