Basic Information

Symbol
hsa_PDS5B_0021200
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0029957 hsa_circPDS5B_049 hsa-PDS5B_0053
Host gene
PDS5B
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
13:33281071-33309467 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
13:32706934-32735330 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-128.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -140.18 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 121.18
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((..(((((.....)))))............(((((.(((((((((((((.((((.((((((......(((....(((....((((((........))))))..)))....))).....)))))))))))))..))).)))))))..(((..((((((((...(((((((.(......(((((((((.(((.(((((....)))))...................(((((((((((..((((.(((((...))).....))...))))..)))))))))))))).)))))....)))).....((......))).)))))))...)))..))))).))).)))))(((((((...((((((..((((.((((.((((...(((.....((.((((.....)))).))..)))...)))).))))....)))).....(((...)))...))))))..))))))).......)))((.(((((....((((((..............))))))..((((((...))))))...(((....))))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((............|{{{{.....{{,.,{{(((,..((((((((((((,{((((.((((((...,,.(((....(((....((((((........))))))..)))....))).,...)))))))))))))..))),}))))))...||}}||{{{{{{...(((((((.(,.....(((((({((,{{,.(((((....)))))...................(((((((((((..((((.{{{((...,,,.....))...))))..)))))))))))}}}.)))),....}}},.....{(......},).)))))))...}}}..}}}}}.}||{||},|{{{{{{{..,{{,{{,.,(({{.((((.((((...(({.,,,{,(.{(((.....))))}}},,)))...)))).))))....}))}.....,{{,..})}},}}}}))),,})})))}.......)))((.(((((....((((((..............))))))..((((((...})))))...{{{....))})))))))
Forensic Context

No forensic context available.