Basic Information

Symbol
hsa_PDS5B_0026100
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0029969 hsa_circPDS5B_067 hsa-PDS5B_0277
Host gene
PDS5B
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
13:33327470-33344698 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
13:32753332-32770560 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-310.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -334.43 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 394.93
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..((..((((.((......((((..(((((((......(((((......(..(((((..(((...((((((.(((..(((((.((((.....))))...)))))..))).((((....)))).(((((...((((....(((....(((((((................((((((....((((.((((((.....))))))(((((....)))))(((((((.(((((((((..(((((.((((((....(((.(((((((.....(((((((((((((((...(((((..(((((.((((((.(((((((((((....))))))))))).)))))).....(((((.(((((.............((((.((((((((((((((......))))))))......................((...))..(((.((.((((................))))))))).))))))))))))))).)))))....))))).....))))))))))..))))))..(((((...(((((...(((...(((.(((((((((((((...((((......(((((((.(((.............(((((.((((..(((((...(((((((....)))))))((((.((((.....)))).)))).(((.......)))...))))))))).)))))........(((.(((..((.....)).)))...)))..(((..(((.....))))))......(((((((((((..........)))))).)))))...))))))))))........(((((..(((((((........)))))))..))))))))).......)))))....))))))))..))).....))).))))).....))))).(((....))).((..........)))))).....))))))).))).....)))))))))))...)))...))))))............(((..((((.....((...((((((...((((((....))))))....)))))).....))....)))).)))..)))))))................................))))....)))))).................(((..(((((((......))))))).))).)))))))......)))....))))...)))))......)))))).........(((...(((((..(......)..)))))....)))........)))..)))))..)......)))))......)))))))........))))...)).))))))......
Thermodynamic Ensemble Prediction
,.{(,.((((,(,..,,..,,((,{(({{{(({...{,((,{,.....,{..,,,,|,||||..}||{{{|}|||}.,||||,||||.}}..}|)|{{{|||||..,,,,(((({,,.||||{(((((,{{((.({{{.,(({{{{(((,,,,..}}}}}}...}}}..||||,||}|.|||{.{(((((.....)))))}{({{,....}}}}}{||||||}|,(((((((,.((({{,{{{{{{,,,||{{.{{{{(((,.,,,(((,.....|}}})),...{||||||||,{,((((((.(((((((((((....))))))))))).)))))).,,..|||||.,(((({..............,}}|||,,,((((((((......))))))))....................,,{{...,,..{{{.{,.{|{{...............})))))||||{|||||,|||||,|||{{,,,,..))))).)}}...|}},}))))))}))}}||..(((((,..{((((,{{(,(,..{{(,(({((((((({(({..((({.{{{{.,,{((({.,{,,,,...,,,,.{{({((({(((,..(((({...,,|||||,(((((({|..,,....,,,.....,,)))))))}|(({......||,...}},,,,))),||||,..({,{.{((({((,..,{.....,,.}}}...|||,.,{{..|||..||.)}}))}......(((((((((((..........))))))}}))))...)}}}}}},,},,.,,.,.||||,..(((((((........))))))),,|}}},,))).......,}}}|,,,{|}||}},,.,)),.,,}})),.))))),,,,,)}}},.})),.,.(((.(........}))),}}},.....))))))),)))}}}.}))})))}})))}}},}}..{||||},.{{{..{{{,..(((..((((...,.((...((((((...((((((....))))))....)))))).....))....)))).)))......|||((............,,......,.........}}},.,,.))}|||.......}},.......(((..(((((((......))))))).))}.},}},,.....}}))).....,,....(((({......)))))..........|||}..|||||,,|.....,)}.})))),}}}}}............|||}}....}{{,.,.,,,)))}....)),,,,)}.}}}}.}}})}.,}))}))))))},),.,
Forensic Context

No forensic context available.