Basic Information

Symbol
hsa_chr13_0121000
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-PDS5B_0159
Host gene
PDS5B
Type of circRNA
Intergenic-Intergenic
Location (GRCh37)
13:33167022-33169741 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
13:32592885-32595604 UCSC (hg38)
External Database
circbank

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-636.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -694.72 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 843.05
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((...(((.(((((((((((((((....(((((...)))))....((((..((.((((..((((((..(((((((((.............(((((((......)))))))((((((((.((...((.......)).)).))))))))..))))))))).........)))))).)))).))..)))).....))))))))))..(((((((..(((((((.....(((........((((((..(((((...)))))...))).)))........)))))))))).)))))))..........(((((((.((....)).)))))))((....)).....(((((..(((((((.(((((((((((...))))).(((((((....((..(((((((..........)))))))......((((..((((((((...))))))))..))))........(((((((((...((((((((((......(((((((..(((..((((..(((((.....(((((((..((........))..)))))))........(((..((((....((((((((........(((((((((((((((.((((((((((((.....(......).....)))))))......))))).......(((((((((..............(((.((....))...))))))))))))........)))))))))......(((....)))...((((.....))))...(((((.....(((........)))....)))))................))))))..((((((..(((((((....(((((.......))))).(((((.(((.(((((........))))).))).((.((((((((((..(((..........(((..((((...(((......)))...)))).))).........(((((......(((((((..........))))..)))......)))))..........(((....)))...)))..))))))))))..))(((.((((............)))).)))....))))).))).))))..)))))).))))))))........))))..)))((((.((...(((((....))))))).)))).......))))).))))...))).)))))))....))))))))))...)))))))))...(((((.((((((((.........))))))))(((((.((......)).)))))...((((.....(((((..(((((...........))))))))))...)))).(((((((......(((............)))......))))))).........)))))..........))....))))))).(((((((.................))))))).((((.(((.((((((((.((...(((((((((......(((.((((((((..(((.((((.((((.((((((((((((...(((..((((((((.((((((...))))))...(((...)))))))).)))..))))))))......))))))).)).)).)))).))))))))))))))...)))))))))...)).))))))))......((((((.....(((((.......))))).((((((((......))))))))............))))))...))).))))............)).)))).)))))))..)))))))))).)))..))((.((((....(((.......)))...))))..((((((..((..(((.......)))..))..))))))(((..(((...((((.((((((............((((((((...............................(((((.((((.((((((..(((((.......((.(((((..((..(((((.......)))))..)).))))).)).((((.(((((((.((...(((((((.(..((.((((.((((((...(((.....))).))))))..)).)).))..))))))))...))..............((((.(((......(((....)))......))).)))).))))))))))).(((((((((((((....(((.((((.....(((..(((((((.((((....)).)))))))))))))))).)))...))))).))))))))...((((((((((.(........).))))).)))))....))))).))))))))))..)))))..(((.(((....))).)))(((((((((.....)))))))))..)))))))).))))))..)))))))...)))......((((((.((((..((((..(((((((.........((((....(((.((((((.........(((((((.....)))))))...((((((.....(((((...((...(((((((........(((((((((((..((((((..((((....))))...........))))))....))).)).)))))).))))))).))..........((((.........)))))))))))))))....((((......))))....................))))))...)))))))........))).))))...)))).)))).))))))......))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((((.((((.((((((((,{{{,...(((((...))))).,{{(,,({,{({((((,.{(((((({{..,,,,,,..,..,||...}}||||,}}.,..||)))))}}|,,}}}|.......{{{,{|||||,,{{{{,},},.....,,,,.}))}}..)}}}))})))}.)}}),))..||||.....(((((,(({..((((((((...((((((,,,.............,,,.(((((((((((((((((.{{{{.,{{|||,..,{,{,,............,}}},...,,...(((((({,((.....))))))))).,.}}}}},.,}}(((((..(((((((.(((((,(((({...})))).{((((((,...((,,((({,,,......}}}})))}}}}......{{{(.,(((((({,...))))))))..)))}........{(({,,,{({{((,,,,.{({{{{{(.((((((({{,(((({..,,..(((((((.,,{{(((((({(((((.((((...(((((((.(((((....((((((((((.{{((((((((,,(.{,,((((({(((((((((.((((((((((((.....(......).....)))))))......))))).......(((((((((..............(((.({....}}...))))))))))))........)))))))))......(((....)))...((((.....))))...,,..,.....,|,....,{|,|.,....,,,|{{{,,.....}}}}}}.))}}}}..{{{({,..{,,,,|},,..|{{{{.......|||||{(((((,(((.(((((........))))).)))...,((((((((,,..,,{..,{{{.....}}}}{(((.,.(({......}))...)))}}}}}}}},,,..{((((({{....(((((((..........))))..))).....{|||||{..{{{{{{.(((....,}}..,|}}..|||||||,},}}}}|{|.((((.|,,....,},.)))).}}}..{{||,,|.,...})),,,))}}},.}}}.))))))...,}}}}}}..}))||||},....,,,,,}}}}))))))))}))),...,,.}}}}.,,})}.,,}.,.}|}}}}}}..}}}},}.)))))))))).....)))))...))))))))))).))),)}}|,,,}}}}|((((.((......)).))))}.}}}}}..})))))}..|||||,|}}},,....,,||||||}}||,.,,||||(((((((......{{(,,,{{{......,))},,,,.)))))))..,}}}.}}}})))),}}}}....}|..,.}}}}}}),|||{{{{,..,.,,..........||||}||,||||.{{{.((((((((,((...(((((((((......(((.({{,,,,({{((({((((.((((.(((((((.((((,,,{({,{(({{,,{{.{{{{{{...}))))),.,{{{...,}}}|||||.,,..,,)))))}...}}.))))))).)).)).)))}.})))))))))))))..,)))))))))...)).))))))))......{(({{{.,,..{{(((.......))))).||||||{{,..,{{,||||},,..,,,,}}},,,)))})}.,,))).)))).,,,,}}}},..)}})))).))))))),,)))}}.(((({{((((((..,{........{((((..,.{(((....,,..((((((..((..(((.......)))..))..)))))),,||,((((((...{.((((((.,,,,,.......{{{,{,......|,.,,........,,,....,,,,,,{...,..,{,,{,,{{,..{{,,{{{{,,,,||.(((((..((,,(((((.......)))))..)}.))))).|{{({|,...}})))),{,..|}}|})),)))))),|.)))))).|,,,..))}),..))))),((({...})))...,|{{{|,||....................}}.}))).),))))))))))).{{{......))).))))))))))).)))))).((((((((,.{(((...(((({{{(((.((,(((((((.((((....)).))))))))),,}}.,||,,,,}}},.))}))))))...))))}..))))))))....}}})})({{{{...(({,,{{{{{{.||,,,,,,,...,,},,.,(((.(((....))).))){((((((((.....))))))))}..{|{{,,|..,||,}}}}{({{,|....,,,}}},...{{{({..............}}}}}}|.}}}}}}))))....))))}})))))))}}}.))))).,,,.}}}}.,)))))))).))))..))))),|{.{{{{.,,,,{{,((({({((((((((((((((((((((,......),.}))))))..))})))))))).)))))))|{{(((.((((.(((.((({..{(((...((((((.,........))))))....)))))))))).)))))))}},{{((({{{..{{,.,{{{{.......)))}},{{,{{{,,(((({..,},,..,,)}}},}.,,)))))))).}))}..,)))))
Forensic Context

No forensic context available.