Basic Information

Symbol
hsa_PDS5B_0001800
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-PDS5B_0241
Host gene
PDS5B
Type of circRNA
Intron-Intron
Location (GRCh37)
13:33203430-33203908 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
13:32629293-32629771 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-118.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -128.00 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 81.41
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((((((......((((((..(((....((((((...((((....(((((((......((((((((...))))))))(((((((((.((....)).))).))))))..((((..((((((....)))))).))))((..((..((((((........)))))).))..)).....(((((((((.(((((((((....)).)))))))...)))))))))..((((....))))........(((.((((.((....))..)))).))))))))))....))))...((((...............))))...(((.((((((.(((....))).)))))))))))))))......)))...)))))).)))).)))).))((.(((((((((((((((...((((((((...))))))))..)))))).(((.....)))((((((........))))))...)).)))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((((((({....,,((((((..(((....((((((...((((..,,(((((((...,,,((((((((...))))))))(((((((((.((...,)}.)))},)))))..((((..((((((....)))))).)))},,..{{..((((((........)))))).}}..|},,...{((((((((.(((((((({....}}.)))))))...))))))))}{,((((....))))..,,....(((.((((,({....))..)))).))))))))))..,,)))),,,((((...............))))...(((.((((((.(((....))).))))))))}))))))......)))...)))))),))))))))).))({{(((((((((((((((...((((((((...})))))))..)))))).(((.....})){(((((........)))))}...)).)))))))))
Forensic Context

No forensic context available.