Basic Information

Symbol
hsa_PDS5B_0004400
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-PDS5B_0259
Host gene
PDS5B
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
13:33222891-33316865 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
13:32648754-32742727 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-675.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -726.19 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 574.81
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((.(((.((((((((((((.((.............)))).)))))))))).))).).))))).((((..((((((....(((((((((...)))))..(((((((((((((..(((((((....)))))))........((((((..(((..(((((..(((((((((((...((((((............))))))...)))).))))))).....((((((((.(((((((...(((((((.((.....(((((....)))))..)).))))))))))))))......((((..((((((((..((.((.....((((((((((.......)))).)))))).....))..))..))))))))..))))...(((((..((...........))..))))).....))))))))..(((((((((((((((((......(((((((((((....(..(((((..(((...(((((.((.(((.((.((((((((..((((((((..........((((....(((((.....(((((((.(.((.((((.(((((((((..((((((((....))))))))..(((((.((((....)))))))))(((.((((.....)))).))).)))))))))..))))..)).)...))))))).)))))....))))..)))))))).....((((((....))))))........................))))))))))))).)))))))))))))))..)......)))))))))))...)))))).....(((.(((((....(((((((..(((((((.((((((.((.((((..............)))).)).)))))).......(((((((((((....((((....))))...)))....((((...((((((((.((((.....((((((........))))))...(((((((.....((((((((((((.((.((.(((((((.(((.......))).))))).))....((((..(((((((.....(((..(((((..(((((((....((((....)))).((((..((...((((....)))))).))))(((((((.((((((((...))))))))))))))).....))))))).))))).))).....(((((((.((.(((.((((......)))).))).)).)))).)))..)))))))..)))).((......)).)).)).))))))))))))........((..((((((.........(((((..........))))).........))))))..))........)))))))(((..(((((((....)))))))..))).(((((.....)))))..))))))))))))...)))).))))))))......................(((((((..........((((((.((((((((..((((((.((((.....))))))))))(((((((((..(((((............)))))((((((((...)))))))).((((((...(((.(........).)))....)))))).)))))))))....)))).))))...)))))).......(((((.(((....))).))))))))))))(((....)))..(((((((((.....(((.((.((.((((((...((........)).))))))..)))).)))(((......)))((((((..((((((.........))))))......(((((....))))).))))))....(((((((((.((((((......))))))...))))))))))))))))))((((((((((.....))))))..))))..........)))))))....)))))))((((...(((((((((((((.((((.((((((......(((....(((....((((((........))))))..)))....))).....)))))))))))))..))).)))))))...))))...........(((((((.(......(((((((((.(((.(((((....)))))...................(((((((((((..((((.(((((...))).....))...))))..)))))))))))))).)))))....)))).....((......))).)))))))..(((((..((((..(((((..(((((..((((((.....)))))...)..)))))..))))).)))).....)))))))))))))))))))))))))))))..))).)))))))))))).(((....((((((((...(((.......)))..))))))))..))).)))))))....(((((((.((((..(((((...)))))(((((((....))).)))))))).)))))))..............(((.((((.........((((((...((((((..(((((((((....((.((((((((...)))))))).)))))))).))).......................)))))))))))))))).)))..(((.............)))....))))....))))))....))))..........
Thermodynamic Ensemble Prediction
,{(((,.{((.((((((((((((,({..,,...,,...}),)),,))))))))).))).}.}}|||.((((..((((((....(((((((((...})))}..(((((((((((((..(((((({....)))))))........{(((((,.(((..(((((..(((((((((((...((((((............))))))...)))).))))))).....{(((((((.(((((((...(((((((.((.....(((((....)))))..)).))))))))))))))......((((..((((((((.,({.{{.....((((((((((.......)))).)))))).....}}..}},,))))))))..))))...,,{{{{{{..........,,|||.,,},},,...))))))))..{((((((((((((((((....,.(((((((((((....(..(((((..(((...(((((.((.(((.((.((((((((..((((((((..........{(((,...,{,...,{(,{((((((.{.((.((((.(((((((((..((((((((....))))))))..(((((.((({....}))))))))(((.((((.....)))).))).)))))))))..)))}..)).}...))))))))))))),...}}}}..)))))))).....((((((....))))))........................))))))))))))).)))))))))))))))..)......))))))))))).,,)))))).....(((.(((((....{((((((.,(((((((.((((((.((.({{,...,,,..,,....}}}}.,,.}))))}..,,{{,(((((((((({....((((....)))),,{|||,...,(((,{,(((({{(({((((.,,..((((((........)))))).}}|{{{{{{,||..((((((((((({..{{{(,(((({((.,{{.{{{,..|))},}}||||,....((((..(((((((.,,,,({{..(((((..(((((((....((((....)))}.||||.....,.((((....))))},,,,|.(((((((.((((((((...))))))))))))))).,...))))))).))))).,,,.,,||((({{{|.((.((({(,,,.....})))).))}.}}.)))}.)))..)))))))..)))).{{,.....}||||.,||||}}}}})))),........{{..{(((((.....,,..(((((..........))))).........)))))}..))..,}....,,}}}},(((..(((((((....}))))))..))).(((((.....)))))..))))))))))))...)))),)))}}))}.......,......,,,..,}}|||,,,{,,.,{,{,..,{{|||,|(((((,{..(((({((((((.....)))))))))),,{{|||||..,||||,,,,,,,,,.,,))}|(((((({((,...}}})))}}||||||...||{.|,},,,,,,,.))),}},}}}}}|{||||||||,...,)))},)))),..,))},|{{{{...(((((.(((....))).)))))))))).{(((....))),((((((((((,....{{{.((.{{.{{((((...((........}}.)))))}..)}}).))){|},,,|,..,}|||{((.,((((((.,,.,,....|||||....,}}||,|,.}}),}}.,)))))).,..{((((((((.((((((......))))))...))))))))))))))))))),,,{(((((.....))))))..))))}})}}}}}..))))))).,..))))))}((((...((((((((((((,{((((.((((((...,,.(((....(((....((((((........))))))..)))....))).,...)))))))))))))..))),}))))))...))))|,,,.,,,...(((((((.(......(((((({((,{{,.(((((....}))))...................(((((((((((..((((.{{{((...,,,.....))...))))..)))))))))))})}.)))),....}}},.....((.....,},).)))))))..{|||{..||{{..(((((..(((((..{(((((.....)))))...}..)))))..))))).)))}.....))}}})))))))}))))))))))})))))..))).}))))})))))).(((....((((((((...(((.......)))..))))))))..))),)))))))....(((((((.((((..,{(((,,{||||,{{,,|||.}},))),)),,)))).)))))))..............{(({(({{.}},,,...((((((...((((((,,(,.{{|||{....((.((((((({...}))))))).)))))))|,|||..,{........,),.,}},...)))))))))))),}}}.,,,.,{((,,..........,)},,,,}))))....))))))....)))),},.......
Forensic Context

No forensic context available.