Basic Information

Symbol
hsa_PDS5B_0004500
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-PDS5B_0270
Host gene
PDS5B
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
13:33222891-33327674 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
13:32648754-32753536 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-763.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -821.02 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 910.16
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((((((((((((((((.(((...((((((((..(((((((...(.((((...........)))).)...))))...........(((((...)))))..(((((((((((((..(((((((....)))))))........((((((..(((..(((((..(((((((((((...((((((............))))))...)))).))))))).....((((((((.(((((((...(((((((.((.....(((((....)))))..)).))))))))))))))......((((..((((((((..((.((.....((((((((((.......)))).)))))).....))..))..))))))))..))))...(((((..((...........))..))))).....))))))))..(((((((((((((((((......(((((((((((....(..(((((..(((...(((((.((.(((.((.((((((((..((((((((..........((((....(((((.....(((((((.(.((.((((.(((((((((..((((((((....))))))))..(((((.((((....)))))))))(((.((((.....)))).))).)))))))))..))))..)).)...))))))).)))))....))))..)))))))).....((((((....))))))........................))))))))))))).)))))))))))))))..)......)))))))))))...)))))).....(((.(((((....(((((((..(((((((.((((((.((.((((..............)))).)).)))))).......(((((((((((....((((....))))...)))....((((...((((((((.((((.....((((((........))))))...(((((((.....((((((((((((.((.((.(((((((.(((.......))).))))).))....((((..(((((((.....(((..(((((..(((((((....((((....)))).((((..((...((((....)))))).))))(((((((.((((((((...))))))))))))))).....))))))).))))).))).....(((((((.((.(((.((((......)))).))).)).)))).)))..)))))))..)))).((......)).)).)).))))))))))))........((..((((((.........(((((..........))))).........))))))..))........)))))))(((..(((((((....)))))))..))).(((((.....)))))..))))))))))))...)))).))))))))......................(((((((..........((((((.((((((((..((((((.((((.....))))))))))(((((((((..(((((............)))))((((((((...)))))))).((((((...(((.(........).)))....)))))).)))))))))....)))).))))...)))))).......(((((.(((....))).))))))))))))(((....)))..(((((((((.....(((.((.((.((((((...((........)).))))))..)))).)))(((......)))((((((..((((((.........))))))......(((((....))))).))))))....(((((((((.((((((......))))))...))))))))))))))))))((((((((((.....))))))..))))..........)))))))....)))))))((((...(((((((((((((.((((.((((((......(((....(((....((((((........))))))..)))....))).....)))))))))))))..))).)))))))...))))...........(((((((.(......(((((((((.(((.(((((....)))))...................(((((((((((..((((.(((((...))).....))...))))..)))))))))))))).)))))....)))).....((......))).)))))))..(((((..((((..(((((..(((((..((((((.....)))))...)..)))))..))))).)))).....)))))))))))))))))))))))))))))..))).)))))))))))).(((....((((((((...(((.......)))..))))))))..))).)))))))....(((((((.((((..(((((...)))))(((((((....))).)))))))).))))))).........)))..)))))))).))))))..)))))))).((((((..(((((((((....((.((((((((...)))))))).)))))))).))).......................))))))..))))))))(......(((((((.(.....((((((((.....((((.(((((......((.............)).....))))).))))...))).(((((((((((.(((.((((((((((((.....(((((.((((.........(((((......((......))(((((.......)))))......))))).((((....)))).)))).).))))..))))...)))))))).)))..)))))......((...)).(((..(((((.((((.....))))...)))))..))).((((....))))....(((((((.((((..(((((((((......))))))...)))..)))).)))).)))..)))))))))))).))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((({.(((.((((((((((((,(,..{,...,,...}),)),,))))))))).))).,.))))),{{{{{{({{.,(({,,((((((,({..,|||||..,,{(({({(({(({{(((({{,....||}|||}.....,..,{,{{{..,,,..|||{(,.(((((((((((...((((((............))))))...)))).)))))))...,.,||||||,}|||||,,...|||||||.{{...,.(((((....))))).,})|)))))))))||))}..,{{{(((({.,,,,(((({((..{(,{,{,(((((({{((.......)))}.))))))..,,,|,,,||{{||||||||..,|,,..,....}}}}}.,..,||,,|,|{{{,,,,,,,,}}})))}}}|.,{|{{|||{((((((((,,,,.{,,((((({(((({.{,(..({(((,.{((...(((((,{(,((({((.(,(((((({{((((,{{{.......,{{((((...........,,,,{{,{((,,,(({((((.((,,{{||{},||||||,|,,,.|}}||||,,,,(((({((((,...|||}|||||{{(,((({....,||||.|||,||||},}|}..||||{{,,{|{..|||,}|||||}||...,||||{{,}||}|||{{...((((((....))))))......................,,|||}||||,||||||||,}},|||||||}..,{{{{{{||||||||,||...||||||{{,.{((,.,,,,,.}}}.||||{,,}|||,,,|}||||||.{{.,,.....,,|{{{{..,{{||,.,.,|||||{.{({{,.(((((((((((....((((....))))...)))....((((.,.(((((((({((((.....((((((........)))))).||{((({((,|{..((((((((((({.,{,{{,(((({((,{{{.,{{,..}))},}}|||},....((((..(((((((.,,,,({{..(((((..(((((((....((((....)))}.||||.....,.((((....))))},,,,|.(((((((.((((((((...))))))))))))))).,...))))))).))))).,,,.,.||((({{{|.((.((({(,,,.....})))).))}.}}.)))}.))}..)))))))..)))).{{......}}|}}.,}|}))))))))))}........{{..{(((((.....,,..(((((..........))))).........)))))}..))..,}....,}}}}},(((..(((((((....)))))))..))).(((((.....)))))..))))))))))))...)))).))))))))................,..,|,{{{{{{{...,,.,{,.((((((.{(((((((..((((,((((((.....)))))))))){{{{{((((..,{(((............)))}|((((((({...,)))))))}((((((...(((.{........}.)))....)))))).))))}}}}},...)))).))))...}))))),|||...(((((.(((....))).)))))))))),|(((....))),((((((((((,....{((.((.{{.{{((((...((........}}.)))))}..)}}).))){|},,,|,..,}|||{((.,((((((.,,.,,....|||||....,}}||,|,.}}),}}.,)))))).,..{((((((((.((((((......))))))...)))))))))))))))))))...,{{(((.....))))))}},))))))),})},,))))))},},,))),})}||||...((((((((((((,{((((.((((((...,,.(((....(((....((((((........))))))..)))....))).,...)))))))))))))..))),}))))))...}}},{{{{,{{{...(((((((.(......{((((({((,{{,.(((((....}))))...................(((((((((((..((((.{{{((...,,,.....))...))))..)))))))))))})}.)))),....}}},.....{(.....,},).)))))))...}}}..}}|||.,(((((..{{{||,.{(((((.....))))).,,},.}})))..))})),}}}|}}|||,}}..))))))),|}}||||}}||||}}}..,,}.,,,,,.,|}}}..|||....{{||||{{...(((.......))),.})))))}}.})))})),,)))}},.{((((((.{(((.,,{(((,{{||||,{{{{{{{.,,,))).))}})))).)))))))...,,....,,...}}}}})}}.))))}}},}}|,}},}}}|||||}}}}.||||||....||.))|||||}}}}))),))))}})))))},.,||}..|},,,.....},..,},...|||||.,|}}}},|}}||.,||||||,.,,.},,|,,,||}}|||.}}}.,|||}||||....|||||||..........{{(((,{,||||,.||,|{,{,|{{{{{{.{(((((.(((.(((((((((((({,.,,{{((,,((((,,..{(,...,,|({{{,.,{..........,|||}}}}...|{((..(({....)))..)))},},.}},.}))}.).})))),))))...)))))))).)))..)))))},,,,}||,.||,.|{{..(((((.((((.....))))...)))))..)}).{(((....))))|||..,}}))),.})},}))}}))))))))...,,,,,,...))))))))))))))})}}},|{((((.....))))))}),,
Forensic Context

No forensic context available.