Basic Information

Symbol
hsa_PDS5B_0012000
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-PDS5B_0070
Host gene
PDS5B
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
13:33249981-33271039 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
13:32675844-32696902 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-178.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -194.52 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 169.47
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((..(((..(((((((((((....((((....))))...)))....((((...((((((((.((((.....((((((........))))))...(((((((.....((((((((((((.((.((.(((((((.(((.......))).))))).))....((((..(((((((.....(((..(((((..(((((((....((((....)))).((((..((...((((....)))))).))))(((((((.((((((((...))))))))))))))).....))))))).))))).))).....(((((((.((.(((.((((......)))).))).)).)))).)))..)))))))..)))).((......)).)).)).))))))))))))........((..((((((.........(((((..........))))).........))))))..))........)))))))(((..(((((((....)))))))..))).(((((.....)))))..))))))))))))...)))).))))))))..))).......................))))(........((((.((((((((..((((((.((((.....))))))))))(((((((((..(((((............)))))((((((((...)))))))).((((((...(((.(........).)))....)))))).)))))))))....)))).))))...)))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
{{{{.,{{{..(((((((((((....((((....))))...)))....((((...(((((((((((((.....((((((........)))))).|,(((({((,,,..((((((((((({.,,.,{.(((({((,{({.,,,...}))},))|}|}.....((((..(((((((.,,{,({{..(((((..(((((((....((((....)))}.||||.....,.((((....))))},,,,|.(((((((.((((((((...))))))))))))))).,...))))))).))))).,,,.,.||((({{{|.((.((({(,,,.....})))).))}.}}.}))}.))}..)))))))..)))).{{......}}|}}.}},)))))))))))}........{{..{(((((.....,,..(((((..........))))).........))))))..))..,}....}}})}},(((..(((((((....)))))))..))).(((((.....)))))..))))))))))))...)))).))))))))...,,,.....,,.,,.......|,...}}}}|,,,....{{|||.{((((({{..((((,((((((.....)))))))))),{{{|||||..,((((............))))|((((((({...,)))))))}((((((...(((.{........).)))....)))))),||||||||,....)))).))))...})}}}
Forensic Context

No forensic context available.