Basic Information

Symbol
hsa_PDS5B_0016000
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-PDS5B_0302
Host gene
PDS5B
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
13:33262643-33344322 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
13:32688506-32770184 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-565.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -613.08 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 441.72
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
....(((((.....((((.....)))).....)))))..(((((....((((((.((((.....))))))))))....)))))...........(((.((((....(((((((((...)))))))))((((((...(((.(........).)))....))))))...............(((((((.........(((((...(((((.(((....))).)))))))))).((((....)))).(((((((((.....(((.((.((.((((((...((........)).))))))..)))).)))(((......)))((((((..((((((.........))))))......(((((....))))).))))))....(((((((((.((((((......))))))...))))))))))))))))))((((((((((.....))))))..)))).....(((.((((((.(.........((((((...(((((((((((((.((((.((((((......(((....(((....((((((........))))))..)))....))).....)))))))))))))..))).)))))))...)))))).........).)))))).)))...((((((.((((...(((((....)))))...................(((((((((((..((((.(((((...))).....))...))))..))))))))))))))))))).))..(((((....(((((.(((((.((((............((((((((((((((((((..((((((.....)))))...)..)))).((((.((((((((((((.....))))..........((.(((((((..............)))..)))).))((((((((...(((.......)))..)))))))).(((((((.........(((((((.((((..(((((...)))))(((((((....))).)))))))).)))))))..............(((.((((.........((((((...((((((..(((((((((....((.((((((((...)))))))).)))))))).))).......................)))))))))))))))).)))((((((.(((......((.(((.((((((......(((((......((.............)).....))))).((((((((((((((((((((((.(((.((((((((((((.....(((((.((((.........(((((......((......))(((((.......)))))......))))).((((....)))).)))).).))))..))))...)))))))).))))))).(((....))).((((((((..(((((.((((.....))))...)))))..)))((((((((.(((((((((((((((.((((..(((((((((......))))))...)))..)))).)))).)))..((((((.....))))))(((((....))))).)))))))).((((((...(((((.......))))).....)))))).((((((......)))))).....))))))))...((((((.(((((((((((....))))))))))).))))))))))).......(((((...........((((((......((((((((......))))))))..........................((((.((((((((.......(((.((((((((.....((((((((((.(((((.(((((......))))).)))....)).))))))))))..(((...)))....((.(.(((...))).).)))))).)))).)))..((((........))))...........))))))))..))))((((((....))))))...(((((((((..................)))))))))))))))...))))).......))))).)))))...)))))))).....))))))..))).))..))).))))))...))))))))))))))).(((((((((((..........)))))).))))).....))))..)))))).))))))))..(((((((........)))))))..)))).)))))..........((((((.(((....)))..))))))..)))))...)))))...(((....))).............)))))))......)))).)))......
Thermodynamic Ensemble Prediction
....{{({,.....{{{,.....}|}}.....}}))},.(((((....(((({{{((((.....))))))))))....)))))......,....(((.((((...{((((((,(({...,,,))),)}}}}}}...,,,..({{...(((({(((((({,.,.{(((((((({....})))}}))))}....,..(((((...(((((.(((....))).)))))))))).{(({....}))},(((((((((,....{{{.((.{{.{{((((...((........}}.)))))}..)}}).))){|},,,|,..,}|||{((.,((((((.,,.,,....|||||....,}}||,|,.}}),}}.,)))))).,..{((((((((.((((((......))))))...))))))))))))))))))((((((((((.....))))))..))))..,,........,}|||.....,,..,(((((...((((((((((((,{((((.((((((...,,.(((....(((....((((((........))))))..)))....))).,...)))))))))))))..))),}))))))...))))))......}))))))..)))))....})).{({((,{{,.(((((,,..}))))..,.....,,,,,......(((((((((((..((((.{{{((...,,,.....))...))))..))))))))))),}}.)))),....((({{....(((((.(((((.((((........,...((((((((((((((.,{{...,,||,.,,..,{|||.((((.((((...(({.,{,{{(,((((.....)))),}},,)))...)))).))))....})}}...,,,{{...})),,..((((((((...(((.......)))..)))))))).{((((((.{{{,....(((((((.((((..,{(((,,{||||,{,,,|||,}},))),)),,)))).)))))))...,,.........,(({(({{.,,,,,...((((((...((((((.,(,,{{(({{....((.((((((({...}))))))).)))))))|,|||..,{........,),.,}},...)))))))))))),},,.,,}((((((.(((......((.(((.((((((,.....(((((.....,({.............)).....))))).((((((((((((((((((((((.(((.(((((((((((({,...{{((,.((((,,..((,...,,|({{{,.,(,.........,||}}}})...{(((..(({....)))..)))}}},.}},.}))}.).})))),))))...)))))))).))),,)}}||(....}||,((((((((..(((((.((((.....))))...)))))..)))((((((((.(((((((((((((((.((((..(((((((((......))))))...)))..)))).)))).)))..{(((((.....)))))|{(({{....}))}}.)))))))).{{{({({.,(((({.......))))}....,}|||}}.({((((......}))))),,...))))))))...((((((.(((((((((((....))))))))))).))))))})))}.......{((((.....,.....{{{{{{,.....((((((((......))))))))..........................((((.((((((((.......{{{.((((((((,,,..{(((((((((.,.(((.(((((......))))).)))....},,)))))))))),|((,...}})....{{.,.(((...})).}.,}}}}},}}}}.}}}..{({{........))))...........))))))))..)))){{{{((,,,.}}}}))}},(((((((({.................,)))))))))))))}}.,.))))}.......)))))}}))))...))))))))....,))))))..))).))..))).))))))...))})))))},,,,,,.(((((((((((..........))))))}}))))...,,,.,}..)))))).))))))))..(((((((........)))))))..,))).)))))..........((((((,((,...,)))..))))))..)))))...)))))...{{{....|||.(,.......,,})}}}}........)))).))).....,
Forensic Context

No forensic context available.