Basic Information

Symbol
hsa_PDS5B_0018200
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-PDS5B_0132
Host gene
PDS5B
Type of circRNA
Intron-Intron
Location (GRCh37)
13:33271625-33272578 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
13:32697488-32698441 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-227.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -250.73 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 232.79
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(....)(((((..(((.....((((((..(((((.(.((((((((((((.((((((((.((((.(((((.....((((((((((.....(((((..(((..(((((....((((.(((.(((((((...((.....(((.(((.((....(((((.........(((((..((((((((((((.(((((((((...))))))).)).)))(((((.(((..(((.....)))..)))..))))).(((......)))...))))))))))))))((((....)))).........((((.......)))).......((((((.((((((((.((((.((((....))))))))..)))))........(((....)))..((((((....((((((((....))))))))..(((((((....)))).)))....((((((((........)))))))).....))))))......))).))))))(((((((((((((...................))))).)).)))))).)))))..))))).)))))...))))))).))).)))))))))))).)))))....))))))))))......((((..((........))..))))))))).)))).).))).))))..)))))))).(((.((((((((...((((.(.(((......)))).))))........(((((....)))))..................)))))))).))).(((((((..((((((((((..(((((.((((((((.((((((((......))))))))))))))))...)))))..)))......))))))))))))))..........................((((((......)))))).)))).).)))))..))).)))..(((((....))))).....))).....)))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(....)(((((..((......{{{(((..{((((.,,({((((((((((.(((((((.,((({.(((((..,,,((((((((((.....(((,,..,....(((((....((((.{({.(((((((..,({.....,{|.||||,,...{((((({......,}|||||..((((((((((((,(({{,,||||,.,}}}}}}.}}.}},(((((.(((.,{({.....}))..)))..))))).(((......)))...)))))))))},|||(,{({{{{||,,..............}}}}..})),.}}}}.,((((((.((({((((.(((,{((((....))))))))..))))}........{((.....,},.((((((....((((((({....})))))))|.(((((((....)))).))).,..((((((((,......,)))))))).....))))))......))).)))))){((((((((((((...............,...))))).)).)))))|{{{.....,)))}.,,}}}...))))))).})),))},)))))..,.,}}}},,..))))))))))......,{{{..((........}}.,))},))))).}))).}.)))}})))..)))))))|.(((,({((((((,..{{{,.{,,({,{....}))},}}}}.......|{{(((,...,))}},,,,,}}.}}}},.....}}}}}}}|,}||,{{,{,,,.,|||{||,|||..{{{((,((((((((.((((((((......)))))))))))))))),,.,}}}}..}}}||.,,.,,||}}||||||},....,}}},....,....,||,,,..((((((......)))))).,)))}),)}))),.|||.|||{.(((((....))))),}},,})}..},.)))))
Forensic Context

No forensic context available.