Basic Information

Symbol
hsa_PDS5B_0019500
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-PDS5B_0271
Host gene
PDS5B
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
13:33275460-33347462 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
13:32701323-32773324 UCSC (hg38)
External Database
circbank

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-635.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -685.00 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 594.99
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
........((((....))))((((.((((.(((((..((((..(((((((((.((((((......))))))...)))))))))..(((.(((((((((((((.....))))))..)))).........))).))).....(((....)))....(((((((((((((.((((.((((((......(((....(((....((((((........))))))..)))....))).....)))))))))))))..))).)))))))...(((((((((((((..(((((((.(......(((((((((.(((.(((((....)))))...................(((((((((((..((((.(((((...))).....))...))))..)))))))))))))).)))))....)))).....((......))).)))))))............((((((....))))))..(((((((((..((((.((((.((((...(((.....((.((((.....)))).))..)))...)))).))))....)))).....(((...)))....((((((((...(((.......)))..))))))))..((((((..((((...(((((((.((((..(((((...)))))(((((((....))).)))))))).)))))))...............((((((((.(((..((.......))..))).)))(((((((........)))))))....(((((((..((((((((((.(..((........))..)))))..(((((.((((((.(((((...(((((((.....(((((((.((((.....((((.(((((......((.............)).....))))).)))).......((((.((((((.(((.((((((((((((.....(((((.((((.........(((((......((......))(((((.......)))))......))))).((((....)))).)))).).))))..))))...)))))))).)))..))))))....)))).....(((..(((((.((((.....))))...)))))..))).((((....))))(((.....)))..)))).))))))))))))))............))))).)))))).)))))((((((.....))))))............(((((((((((.(((((.....(((.(((((((....(((.(((((((.....(((((((((((((((...(((((..(((((.((((((.(((((((((((....))))))))))).)))))).....(((((.(((((.............((((.((((((((((((((......))))))))......................((...))..(((.((.((((................))))))))).))))))))))))))).)))))....))))).....))))))))))..))))))..(((((...(((((...(((...(((.(((((((((((((...((((......(((((((.(((.............(((((.((((..(((((...(((((((....)))))))((((.((((.....)))).)))).(((.......)))...))))))))).)))))........(((.(((..((.....)).)))...)))..(((..(((.....))))))......(((((((((((..........)))))).)))))...))))))))))........(((((..(((((((........)))))))..))))))))).......)))))....))))))))..))).....))).))))).....))))).(((....))).((..........)))))).....))))))).))).....)))))))...((((((((...)))).))))........(((..((((.....((...((((((...((((((....))))))....)))))).....))....)))).)))......(((((........................(((..........))).(((.......))).......(((..(((((((......))))))).)))............)))))...........(((((......)))))))).......))))).(((((..(......)..)))))....))))))..))))).(((((.....(((.......)))...........((((..((..(((.(((((.....((.....))....))))))))..)).)))).......)))))...((((............))))((((....)).))......)))))))))))))...))))).......((((.....))))....))))..)))))))))).)))))))))))))))))).....))))...)))))..)))).))))((((((.((......)).))))))((((((.............)))))).........
Thermodynamic Ensemble Prediction
.((({{{{.{((....,}|{(((,...||}||((({.{{{,..(((((((((.((((((......))))))...))))))))),,,,,}|||((((((((((.....))))))..))))..,,......,,,}||,.....{{....|{{{...((((((((((((,{((((.((((((...,,.(((....(((....((((((........))))))..)))....))).,...)))))))))))))..))),}))))))...||||{(((((((...(((((((.(......(((((({((,{{,.(((((....}))))...................(((((((((((..((((.{{{((...,,,.....))...))))..)))))))))))})}.)))),....}}},.....{(......},).)))))))...}}}..,}}}|,|{({,,..}||||},,,{{{{{{{{..((((.((((.((((...(({.,,,{,(.((((.....)))),)),,)))...)))).))))....)))).....,{{...})},,.,|||||{{|,,,||{,{{{{{,||}{{|||,||||{{(((,(({.(((({,.((((((({((((.,{((((...}||}}|{{{{((,,,.})}.)}}}||}|,||||||}...,,.........,||||||||}|{{,,{|,,..,,,))}|||}|}}|{((((((........))))))}....(((((((..((((((((({,(..((........}),.)))))..(((((.((((((.(((((..{{{{,,..,..,{(((((((.{(((,{{{{((((.(((((...,.{({.............)).,...))))).))))..,{{{{{{{{.,(((((.(((.(((((((((((({,...{{((,.((((,,..((,...,,|({{{,.,(,.........,||}}}})...{(((..(({....)))..)))}}},.)},.}))}.).})))),))))...)))))))).)))..)))))},,,,|||},|||.{((..(((((.((((.....))))...)))))..}}).((((....)))),||..,..}})}})))}.))))))}}|}}}}.............))))).)))))).))))}((((((.....)))))),,{......,,,{((((((((((.(((((,{..{(((,(((((((...,(((.(((((((.....((((,,,{{{|||||,...(((({{{((({,((((((.(((((((((((....))))))))))).))))))....,|||||..(((({...............}}}}|.,,((((((((......))))))))....................,,{,...,,..{{,.{,.{||{...............}))))){((((((((|,|,{({.(((({......))))).)}}...,)},)))))))))),,|{..(((((...(((((...(((...(((.(((((((((((((...((((.,,,,.(((((((.(((.............(((((.((((..(((((...,{{{{({{{{{{||||..,,,,.,,,,.....,}))}))))}|{||......}},...})))))))).))))).{{,....(((.(((..((.....)).)))...)))..||{..|||.,{{.},,)))......(((((((((((..........))))))}}))))...))))))))))........{||{,..(((((((........)))))))..}))),)))).......)))))...,))))))))..))).....))}.))))).....))))).,}}..,.(((.(........}})),)))}.....))))))).))).,...)))))))}}}|,{{|||...}}))).,}}}..,.....(((..((((...,.((...((((((...((((((....))))))....)))))).....))....)))).)))......(((((............,,......,....,,...,....,.,}},|{{......,}}}.......(((..(((((((......))))))).))}.,.,,.......)))))...........(((((......)))))..........})))}.(((((..(......)..)))))....)))}},..))))}.(((((.....(({.{....})))...........((((..((..((,{(((((...,.((.....)).,..))))))))..)).))))...,,..)))))...((((............)))){{((....)).))......)))))))))))))...............((((.....))))|{{.,,,...))))))))))))))).,,,,,)))))),)..,.}))))}}.)),,))})))}.}}||((((((.((......)).))))))}}|..,.,}}}}},}}...))))),}).......
Forensic Context

No forensic context available.