Basic Information
Symbol
hsa_PDS5B_0025000
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-PDS5B_0086
Host gene
PDS5B
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
13:33315218-33327674
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
13:32741080-32753536
UCSC (hg38)
External Database
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-118.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-130.86 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
155.43
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((..................((...((((..(((((..((((((...((((((..(((((((((....((.((((((((...)))))))).)))))))).))).......................))))))))))))..........(((.............)))..(((((((.....((....(((((((..............(((((.......)))))...((((.((((((...(((....)))...))))))))))..)))))))..)).....)))))))...............(((((((((..((((..(((....)))..))))..........((((((...(((...((((..................))))..)))...)))))).))))))))).))))).))))...))........((((....))))(((.....)))..(((..(((((((((......))))))...)))..))))))))((.(((..(((((.....))))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((,{({,...,,.........,||||{.}})),,....((((((...((((((,,{..{{(({{....((.((((((({...}))))))).)))))))|,|||..,{........,),.,,},...)))))))))))).(((({..,(({,,,.,..,{(((((((.{(((.,{,,((((.(((((...,.{({.............)).,...))))).))))..,||,,|{|{.||{|||,(((.(((((((((((({,.,.{{((,.((((,,..((,...,,|({{{,.,{,.........,||}}}})...{(((..(({....)))..)))}}},.}},.}))}.).})))),))))...)))))))).))),,||||}},{{{|||,.||,.{((..(((((.((((.....))))...)))))..)}).{{||,,,,))))|||..,,,}}),})))}.))))))}}|},},...,,,,,...,.))))).)))))|{,||{.,(((((.....))))))))))
Forensic Context
No forensic context available.