Basic Information

Symbol
hsa_chr13_0122000
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-PDS5B_0224
Host gene
PDS5B
Type of circRNA
Intergenic-Intergenic
Location (GRCh37)
13:33317488-33318348 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
13:32743350-32744210 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-170.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -189.90 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 207.00
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((...(((.(((((......((((((((((..(....(((((...(((((....)))))((((...........))))........(((.((((....))))..))))))))...)..))))).)))))......(((.(((((((((((........(((((((((..((..((((.....)))).((((((.((((((..(((((.(((.....................)))..)))))..)))))).)))))).....(((((((...)))))))....((((((.(((..((((......)))))))..))))))...........(((....)))..((((..(((((..(((((((.................))))))).)))))...))))......................................(((((((((((((((((((.....((((((((((.((((((((((((((((((......)))))......(((((......)))))......))))))))))))).)))))))).))...(((((.((((((((((((((((...(.(((.......))).)..))))).)))))))))))))))).....(((((((.....))))))).....)))))))))....))))))))))..)).))))))))).....)))....))))))))))))))))..)))(((((...))))).((((((((((((((((....((((......)))).......)))))))))......)))))))............))))).((..(((((((((((..........)))))))))))..))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((...{{,.{({(({{{,..{||||||{{{..,{{{{((((,...(((({....}))))(((({{{,.,,.,{{|{|,((({.,,{(((.{,{{.,,,)}}}...,,|||||{{{|{{|||||..||,}...,,.{(,{(((((((({{{........(((((((((..((..{(((.....}}}}.((((((.((((((..((({,.,,{,{,...,.,,...,||,....,})..)))))..)))))).))))))....,(((((({...}))))},.,}}((((({.(((..,{{,......}}},})}..})))))......,,,.,,{{,...,,,..|{{{..(((((..(((((((...,{{......,,...))))))).)))))...,}},...,....,.,....................||,....(((((((((((((((((((.....((((((((((.(((((((((((({(((((......)))))......{((((......)))))......})))))))))))).)))))))).,}...(((((.((((((((((((((((...(,({(.......))}.}..)))))}}}))))))))))))))....,(((((({.....})))))).,...)))))))))....))))))))))..)).))))))))).....}))....))))))))))))))))}....(((({...}))))..|||||||||||,,,,..},||||,,,}..,,))}},.,,.))))))})).,....}})))))}}}.,.,},,},))))).((..(((((((((((.,........)))))))))))..))
Forensic Context

No forensic context available.