Basic Information

Symbol
hsa_PDS5B_0025400
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-PDS5B_0208
Host gene
PDS5B
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
13:33320115-33332357 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
13:32745977-32758219 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-124.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -136.72 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 84.53
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.....((....(((..((((((...((((..((((((((.(((.((((((((((((.....(((((.((((.........(((((......((......))(((((.......)))))......))))).((((....)))).)))).).))))..))))...)))))))).)))..))))))........((((((((..(((((.((((.....))))...)))))..)))((((((((.(((((((((((((((.((((..(((((((((......))))))...)))..)))).)))).)))..((((((.....))))))(((((....))))).)))))))).((((((...(((((.......))))).....)))))).((((((......)))))).....))))))))...((((((.(((((((((((....))))))))))).))))))))))).......(((((...............)))))...((((((((......)))))))).....................)).))))...))))))..)))....))......
Thermodynamic Ensemble Prediction
.....((....(({,,((((((...((((..({,(((((.(((.(((((((((((({,...{{((,.((((,,..((,...,,|({{{,.,(..........,||}}}})...{(((..(({....)))..)))}}},.)},.}))}.).})))),))))...)))))))).)))..)))))}.....|||{((({(((..(((((.((((.....))))...)))))..)))((((((((.(((((((((((((((.((((..(((((((((......))))))...)))..)))).)))).)))..{(((((.....)))))|{(({{....}))}}.)))))))).{{{({({.,(((((.......))))}.....}}||)}.({((((......}))))),,...))))))))...((((((.(((((((((((....))))))))))).))))))})))}.......(((((.....,.........)))))...((((((((......)))))))).....................)),))))...)))))).,)))....))......
Forensic Context

No forensic context available.