Basic Information

Symbol
hsa_chr13_0122300
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-PDS5B_0210
Host gene
PDS5B
Type of circRNA
Intergenic-Intergenic
Location (GRCh37)
13:33330558-33331496 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
13:32756420-32757358 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-210.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -231.36 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 228.33
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Forensic Context

No forensic context available.