Basic Information

Symbol
hsa_PDS5B_0028800
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-PDS5B_0280
Host gene
PDS5B
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
13:33338627-33347462 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
13:32764489-32773324 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-173.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -188.41 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 137.85
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((...((((((..((((....(.(((((..(((((((........)))))))..))))).).............((((((.(((....)))..))))))....(((.......))).(((....))).............))))..)))))).((((.........(((.((((((.((((((((...)))).))))........(((..((((.....((...((((((...((((((....))))))....)))))).....))....)))).)))......(((((........................(((..........))).(((.......))).......(((..(((((((......))))))).)))............)))))...........(((((......)))))..........(((...(((((..(......)..)))))....)))...........(((((.....(((.......)))...........((((..((..(((.(((((.....((.....))....))))))))..)).)))).......)))))...((((............))))((((....)).))..............)))).)))))..........((((.....)))).))))...)))))(..((((..(((((....(((...............(.((((((.(((...)))((((((.((......)).)))))).)))))).)....)))....)))))..))))..)
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((...((((((..((((.,{.,.{{{{,..(((((((........))))))),,||}}}.,}},..........(((((({((,...}))}..}))))).,,,{((.......},..|||,...}}).|........,..))))..)))))).{{{({,,......(((,((({((.((((((({...}))).))))........(((..((((...,.((...((((((...((((((....))))))....)))))).....)).,..)))).)))......(((((............,,......,....,,..........}}|.{((......,)}}......,(((..(((((({......))))))).))).,.,,.......)))))...........(((((......)))))..........{{{...(((((..(......)..)))))....,,,...........(((((.....(({.{....})))...........((((..((..((,{(((((...,.((.....)).,..))))))))..)).))))...,,..)))))...((((............)))){{((....)).}}.......,,,,.,,)))}.,,))).........,((((.....))))}))))...)))))({{((((..,((({....{((...,.....,.,.}},.,,})))..}}}}})||((((((.((......)).))))))|||,||,..,.,,||,...,)))))..,,,,..}
Forensic Context

No forensic context available.