Basic Information

Symbol
hsa_PHKA2_0001400
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0089991 hsa_circPHKA2_030
Host gene
PHKA2
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
X:18917291-18936972 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
X:18899173-18918854 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-372.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -392.80 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 395.64
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((.((((..........((((......(((((......((....))......)))))))))........((((((((.((.(((((...((((((......))))))((((.....))))...(((((((......)))))))..((((((..((..(((..((((...))))......))).))..)))))).......))))).((((............))))(((((.....)))))...(((((..((((..(((.(((((.(((((((...))))))).(((.((((((((((((((....))))).(((((.......((((((((((((...)).)))))).)))))))))......(((((...)))))....(((((((...)))))))(((((....))))).....((((.((((...((((((.....)))).............((((((((((.(((((((((.((((....((..(((.(((((((((...........)))))))))))).))......(((.(((.(((.....)))))).))))).)).))))))...)))..)).)))))))).(((((.....))))).)).))))))))...))))))))).)))((((......)))).((((((....(((......)))....))))))..(((((..((((.((((......(((((....))))).......)))).))))))))).((((...))))))))).)))..))))..)))))((((((((..(((.((((....))))(((.....)))((.(((((...(((((((((.....)))))(((((...)))))(((((.((((......))))..)))))(((.......)))((((((............))))))..((((..(((((............)))))......))))))))....)))))))..(((((((.......))))))).)))..))))))))......)).)))))))))))).))..((((((((((((((.......((...((...(.(((((((.(.(((.(((((........))).)).))))))))))).).))...))...))))))))..))))))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
...((..{(((,...{(((........}}}}.....{(((((((((.........(((((.......)))))..)))))),,))}((((((((((((((..(((.((.((,.,,,.{({({(,((,(((,{{{{{{{|,,||,.{((((((..((..(((..((((...))))......))).))..))))))}}}.}}})).....}}|}}}..}}}....,,,.(((((.....)))))...,,,(((((((((.,,.,(((((.,((((,({{{||||,,|{({,(((((((.({(((((,,,,|}|||.{((((....,..(((((((((({{...,}.))))))}}}))}}}}|,,....(((({...)))))....,{{{{||,,,))}}}))(((((....))))).....}}))))))).,.}}}||}}))))),.)})}.}}}}}}.{(((((({((((.{((,...{{,((((.{,.,,{{((({(((((((((...........)))))))|{|||.||,{{,..((({{(({{{{{{{.,{|||||{|,,.{{.(((({{{{......))))))),)).,,)}||||}},},}||||.}}}}}|||,|,,,..,,}}))}},|}}{||||,....}})),((((((....(((......)))....)))))){{(((.,{,,,,,,|,,}}}}}..{(((({{{,|||||{{{....|)))}}),||||||,||{{..,)))}||{||{|||.,|}}),,))}},{{|{{({{..{{{.((((.{{{((((((..((((({......}))).))..)))))}}.}}.))))|,{||||||}}|||{{,,{,{{,,.},,,.)))),,}}}}||||,||...,}}}}}}}}}.||||.,,....})))},..||{|..(((((............)))))....}))))))),,...}),)))),..(((((((.......))))))),))}..))))))))}}}},.......)))))))))..........},,))))))..,,}..)).)).)))..))))))},{(.((((.....)))).)}.}))))))(({.,,))){|||.,....,.}}}),..,......)))))).
Forensic Context

No forensic context available.