Basic Information

Symbol
hsa_PHKA2_0001500
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0089992 hsa_circPHKA2_028
Host gene
PHKA2
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
X:18917291-18938319 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
X:18899173-18920201 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-414.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -439.82 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 421.99
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..((..((((((((((((((((.(((((((((.((((((..((((.................))))....)).)))).)))))))))((........))...)))))))...)))...))))))..))...(((((((((.((((..(((.((..((....))..)).)))....((((.....))))..................((((((((((.........(((((.......)))))..)))))).))))((((((((((((((..(((.((.((..(((.(((((((((.(((.((((((((..((..(((((((..((..(((..((((...))))......))).))..))))))))).))))).....))))))..)))........(((((.....)))))......(((((((((....((((((..((((.((((((((..(((..(((((((.(((((((....))))).(((((.......((((((((((((...)).)))))).)))))))))......(((((...)))))....(((((((...)))))))(((((....))))).....)))))))))....)))))))))))..)))).)))))).(((((((.((((((((.......((((.((...(((((((((((((((...........)))))))(((((.(((((...((((((((..((((..((((((((...((.(((((((.......))))))).))...))))))))))))((((.....))))........))))))))....)))))....)))))((((((....(((......)))....))))))(((((..((....))..)))))...((((((((((((((((.....)))))).((((((.((((...))))(((((((((.(((((.........))))).......((((.(((((((((..((((((......)))).))..))))))).)).))))..)))))))))...(((((.((((......))))..)))))))))))...)))))))))).((((.......))))..........(((((............)))))....)))))))).....)).))))...(((((((.......))))))).))))...))))))))))).......))))))))).............))))))..)))..)).)).)))..))))))).((.((((.....)))).)).)))))))(((...)))((((.(....).))))..)))))))))))))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
{.{,..((((((({{(((((((.(((((((((.(((({{,,(({,.......,,|......,|}}}..,,)).)))).))))))))){{.,,......,,..)))))))...}},..,))))))..,,.}|(((((((((.((((..,,{{(,.,{,...,||..{{{{|...,.,,,,.,...))))}...,.,..,,.......{(((((((((.........(((((.......)))))..)))))),,)),((((((((((((((..(((.((.((..,,,.((((((,((,(((,{,{{{{||,,||,.{((((((.,((..(((..((((...))))......))).))..))))))}}}.}}})}.....}||}}}..}}}....,,,,(((((.....)))))...,,,(((((((((.,..,(((((..((((.(((((({{,.(({,.(((((((.({(((((,,,,|}||}.{((((....,,.(((((((((({{...,}.))))))}}}))}}}}},,....(((({...)))))....,{{{{||,,,))}}}))(((((....))))).....}}))))))).,.,)}}})))))))..)))).}))))}.{(((((({((((.{((....{{,((((.{{...{{((({(((((((((...........))))))){{{{|,||,{{,..((({{(({,{,{{{.,{{{|||{{,,.((.(((({{{{......))))))).)).,,)}|||}}},},}||{|.}}}}}|||,|,,,...,}}))}|,,|}{||||,....}})),((((((....(((......)))....)))))){{(((.,{{,,,,,}..}}}}}..,(((({{{{{{||(({{....,)))}}),||||||,||{{.,,)}}|{({|((({|.,||||,,}}}},{,||||{,..,||.((((.{{(((((((..((((({......}))).))..))))))}.}}.)))),,{||||||}}|||{{,{{,{{{,.},,,.)))),,})}}}|||,|}...,}}}}}}}}}.||||.,,,,..})))},..,,||..(((((............)))))....)))))))),,...}).))))...(((((((.......))))))),)}},.}})))))))))},.......)))))))))..........},,))))))..,,}..)).)).)))..))))))},{(.((((.....)))).)).}))))))(((...)))((((.{....}.))))..))))))))))))).}
Forensic Context

No forensic context available.