Basic Information
Symbol
hsa_PHKA2_0001600
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0089993
hsa_circPHKA2_027
Host gene
PHKA2
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
X:18917291-18942252
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
X:18899173-18924134
UCSC (hg38)
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-442.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-467.51 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
485.79
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(........)(.((((((((((((((.((((..(((........)))..)).)))))))))))...((((((((((...........((((....((((((((..((((.((((.(((......(((.((((...((((.((((((.(((((..............)))))...)).)))).))))(((((...))))).))))))).....))).))))))))..))))))))...))))...........))((((.....))))..................((((((((((.........(((((.......)))))..)))))).))))((((((((((((((..(((.((.((..(((.(((((((((.(((.((((((((..((..(((((((..((..(((..((((...))))......))).))..))))))))).))))).....))))))..)))........(((((.....)))))......(((((((((....((((((..((((.((((((((..(((..(((((((.(((((((....))))).(((((.......((((((((((((...)).)))))).)))))))))......(((((...)))))....(((((((...)))))))(((((....))))).....)))))))))....)))))))))))..)))).)))))).(((((((.((((((((.......((((.((...(((((((((((((((...........)))))))(((((.(((((...((((((((..((((..((((((((...((.(((((((.......))))))).))...))))))))))))((((.....))))........))))))))....)))))....)))))((((((....(((......)))....))))))(((((..((....))..)))))...((((((((((((((((.....)))))).((((((.((((...))))(((((((((.(((((.........))))).......((((.(((((((((..((((((......)))).))..))))))).)).))))..)))))))))...(((((.((((......))))..)))))))))))...)))))))))).((((.......))))..........(((((............)))))....)))))))).....)).))))...(((((((.......))))))).))))...))))))))))).......))))))))).............))))))..)))..)).)).)))..))))))).((.((((.....)))).)).)))))))(((...)))((((.(....).))))..))))))))))))).)
Thermodynamic Ensemble Prediction
(........)(.((((((((((((((.{{((..(((........)))..)).}})))))))))...((((((((({{,,.{{,...,{((({,,,{{{{{((({{((((.((((.(({,,{{{,({(,{(((,{,((({.((({{{.{{{{{,,,,.,.,,,,|||}}}}}...,,.}}}).})}|(((((...))))),}}}}}}}..,}}))}.))))})))},}})))}}}...,}||,..{{{{{...{.,..,.,...))))}.....,,..,....,..{({(((,,{{,,,...,..(((((.......)))))..)}}}}}.,}},((({((((((,,,,..|||}||.|||.,...{{{{(({(({((({,...,,|}}}}}}.|||{{{{.|||..|||..{|||,,,)))}...,,}))).)),.))))))|||..,,||{,..{||{|,,,{{||...,{{{{({{((..,,,}}}}|{{{{{{(((((((((.,..,(((((..((((.(((((({{,.(({,.(((((((.({(((((,,,,|}||}.{((((....,..(((((((((({{...,}.))))))}}}))}}}}},,....(((({...)))))....,{{{{||,,,))}}}))(((((....))))).....}}))))))).,.,)}}})))))))..)))).)))))},{(((((({((((.{((....{|,((((.{{.,.{{((({(((((((((...........))))))){{({|,,|,|{,..{(({{(({,{|{{{.,{(((({((...((.(((({{{{......))))))).))...)))))))},},}||,|.||}|}|||,{,,{..,,}}}}}|,,,,,||||,,.,.}})),((((((....(((......)))....)))))){((((.,{{,,,,,|,,|}}}}..,((((((({({{{((({....,)))}}).||||||,||{{..,)}}|((({((({|.,||||,,}}}}.,,|||||,..,||.((((.({(((((((..((((({......}))).))..))))))}.}}.)))),,|||||||}}|||{{,{{.{{{,.,,,,.)))),,))}}}|||}}}...}})))))))}.||||.,,,,..})))},..,,|,..(((((............)))))....)))))))),....}).))))...(((((((.......))))))),)}},.}}))))))}}}},...,...)))))))))..........}))))))}}.,},},.,),),,)),..}))))),.,|}|||{..},,)))).}}.,})}}}}(((...))}{{||.|..,.}.)}))..))))))))))))).)
Forensic Context
No forensic context available.