Basic Information

Symbol
hsa_PHKA2_0001900
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0089996 hsa_circPHKA2_022
Host gene
PHKA2
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
X:18917291-18949866 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
X:18899173-18931748 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-615.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -651.07 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 661.81
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((.(.(((.((.........)).)))))).((((((.(((....((((((((..(.((((((....)))))))..))))))))....))).((.((((((((((.((((((((..(((((...)))))....)))))))).....((((........)))).........((((((.((.((.((((((..(((((((((..................(((((...((((........(((((((.((((.((...))..)))).)))))))..)))))))))...((((..((.(((((((((((((((......((.(((((.((..((((.((((.(((((((.(((....)))..))))...))).)))).))))...))))))).)))))))))))))))))))...((((((.((((((...(((((((.((....((((((...(((((......(((......)))......)))))))))))..))...))))))).......((((..(((.(((.((((((.(((....)))....)))...)))))).)))..))))(((........))).((((((...((((((((((.((((..(((........)))..)).)))))))))).....))...))))))..)))))).))))))..((((((((..((((.((((.(((......(((.((((...((((.((((((.(((((..............)))))...)).)))).))))(((((...))))).))))))).....))).))))))))..))))))))...))))...........))))))))))))))))).)).))))))......((((((((((.........(((((.......)))))..)))))).))))((((((((((((((..(((.((.((..(((.(((((((((.(((.((((((((..((..(((((((..((..(((..((((...))))......))).))..))))))))).))))).....))))))..)))........(((((.....)))))......(((((((((....((((((..((((.((((((((..(((..(((((((.(((((((....))))).(((((.......((((((((((((...)).)))))).)))))))))......(((((...)))))....(((((((...)))))))(((((....))))).....)))))))))....)))))))))))..)))).)))))).(((((((.((((((((.......((((.((...(((((((((((((((...........)))))))(((((.(((((...((((((((..((((..((((((((...((.(((((((.......))))))).))...))))))))))))((((.....))))........))))))))....)))))....)))))((((((....(((......)))....))))))(((((..((....))..)))))...((((((((((((((((.....)))))).((((((.((((...))))(((((((((.(((((.........))))).......((((.(((((((((..((((((......)))).))..))))))).)).))))..)))))))))...(((((.((((......))))..)))))))))))...)))))))))).((((.......))))..........(((((............)))))....)))))))).....)).))))...(((((((.......))))))).))))...))))))))))).......))))))))).............))))))..)))..)).)).)))..))))))).((.((((.....)))).)).)))))))(((...)))..).))))))))).))..........)))))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
(({(.(((.(((((((((.,{(((({((,{(.,((({...{{{({.,,}))}}}|},,,,,...}})))))...,}.))))))).)).))}.}).})(({,((({{(((....)))))))}.{((.{(((((..,,.........},.)))))}))}{.((((,.....}))},|{,{{.,.,,,..,},|((({{{..,..}))))}...,,.....((((((...((((({.....(((((((.((((.(,...,)..)))).))))))).......((((....)))).((.((((((((((((((((.,{{,.,.,|||{.((..{{,,,((((,,,,((((.(((....)))..))))}}}))).})))})|||{,.,,))))).,))))))))))))))))))...................(((((((.{(,,,,((((((...(((((......(((......)))......)))))))))))..)).,,)))))))......((((((,,(((((((,(,{{.(((,(.{.((({((..,...,...,((((((,{((.,,,|,|.......|}}}|}..{{{{.{((((((((.{{((,.(((........)))..}).}})))))))}|,,||||((((((.((({,,.....{{(({..{((({(((({{((((,({((,(((..,,,.{{{.,{{{.,.{{{,.{{|||,.{|||,}}}}.}}}}}}}}}}}}}}....,.}}}|,||}|(((((...)))))}||}}|||..,|{||}.||||,}||,,|}|||}}}...,}}},..{{{{{...{.,..,.}...))))},,,..,,,}}.},,,...}}||,..,})},.}})}}||||}},,.})}),))))))|,{{{.....,||}||(((({{{{..|||,||.((,.,,,.{{{{{{,((,(((,,,,,,,||}}||,.{((((((.,((..(((..((((...))))......))).)).,))))))}}}.}}}}},...,||||}}.,||}....,,,,(((((.....)))))..,,,,(((((((((.,..,(((((..((((.((((({{|,.{({,.(((((((.({(((((,,,,|}|||.{((((....,,.(((((((((({{...,}.))))))}}}))}}}}},,....(((({...)))))....,{{{{||,,,))}}}))(((((....))))).....}})))))))...})}}})))))))..)))}.}))))},{{(((({{((({.{((,...{|,(({{.{{...{{((({{((((((({...........))))))){(({{.,|,{{...{{({|(({|||{{{.,{(((((((...((.(((({{{{......))))))).))...)))))))}|}.|||,|.||||}|||{{{{{,.,.}}}|||,|,,,||||,,.,.)})).((((((....(((......)))....)))))),{{{(,,{{{{{,,|,,|}}}|,.,((((((({(({{((({....,)))})).||{|||,||{{..,)}}|((({((({{.,||||,,}}}}.,,|||||,..,||.((((.(((((((((..((((({......)))).))..))))))).}}.)))),,||}||||}}|||{{,{{.{{{,.,,,,.)))),,))}}}}||}}}...}})))))))}.||||.,,,...})))},..,,|,..(((((............)))))....}})))}})|....}}.}))}...(((((((.......))))))),)}},.}}))))))}}}},...,...)))))))))..........,}}))))))..,,,..}).)}.)))..))))))}}.))))))}})..,,}..,,...,)))))),}.),)))),))))))))))))))}))))).)))))))))
Forensic Context

No forensic context available.